Os Cientistas aqui projectaram um mapa novo, interactivo da propagação do vírus da gripe aviária (H5N1) que incorpora pela primeira vez a informação genética, geográfica e evolucionária que pode ajudar a prever onde a manifestação seguinte do vírus é provável ocorrer.
No processo, igualmente testaram hipóteses sobre a natureza das tensões específicas do vírus que parecem dirigir para o oeste e têm a capacidade para contaminar seres humanos.
Uma equipe de peritos biomedicáveis, conduzida por Daniel Janies, um professor adjunto no departamento da informática biomedicável, software especial usado criar uma árvore evolucionária das mutações do vírus. Usaram a Linguagem de Marcação do Buraco Da Fechadura em Google Earth para projectar a árvore no globo e escolheram então cores e símbolos indicar os anfitriões diferentes que levam o vírus e onde vivem. Período, uma outra função em Google Earth, permitido os para animar ao longo da última década a propagação do vírus.
O mapa é superlotado da informações adicionais. Clicar em um subtipo viral específico gera um indicador emergente que revela as mutações diagnósticas que distinguem uma tensão do vírus de outra, e todos os dados são ligados ao Instituto Nacional do GenBank de Saúde.
“O mapa dá-nos uma maneira nova inteira de ver o vírus na acção e compreendendo o que é e não está fazendo,” diz Janies. “Permitiu-nos de comparar resultados sobre vírus no mundo real contra hipóteses pre-existentes sobre a propagação de H5N1 que vêm dos estudos de laboratório.”
O estudo aparece em linha esta semana na introdução de Abril da Biologia Sistemática.
O vírus da gripe aviária foi reconhecido primeiramente em pássaros aquáticos selvagens em Guangdong, China em 1996. Espalhou então às galinhas e aos seres humanos em Hong Kong o seguinte ano. Desde 1997 até 2005, emergiu em diversos os países Asiáticos Do Sudeste e a propagação através dos anfitriões múltiplos durante todo China central e do sul, Rússia, o Médio Oriente e a Índia. Até agora, as manifestações adicionais foram relatadas como distante para o oeste como Europa e África e como Extremo Oriente como Japão, Coreia e Indonésia.
Em criar o supermap, os pesquisadores estudaram dados genéticos de 351 isolados do vírus. Estavam especialmente interessados em descobrir se determinados anfitriões levavam formulários específicos do vírus e que os vírus levaram mutações específicas permitindo a transmissão aos seres humanos.
“Nós encontramos o visualização de camadas múltiplas de informação muito útil em gerar hipóteses que nós poderíamos testar com a análise estatística dos dados da mutação nós organizamos na árvore evolucionária,” diz Janies. “Os resultados ajudaram-nos a compreender se as mutações que parecem ser associadas com determinados anfitriões ou as regiões geográficas apareceram por acaso, ou se eles era adaptações verdadeiras do vírus porque espalhou.”
Os vírus da Gripe são classificados de acordo com diversos critérios: se vêm dos animais ou dos seres humanos, e da actividade de duas proteínas chaves que se sentam na superfície do vírus, do hemaglutinin (HA), e do neuraminidase (NA). O HA ajuda o vírus “vara” a uma pilha de anfitrião e contamina-o; O NA ajuda o vírus a escapar da pilha e a espalhar a outros pilhas e anfitriões. No passado, os cientistas supor que se uma tensão do vírus emergiu essa transmissão de humano a humano permitida, envolveria provavelmente mutações nestas duas proteínas.
Janies e seus colegas não encontraram nenhuns genótipo associada com as mutações nestas duas proteínas de superfície que foram associadas significativamente com o qualquer tipo específico de anfitrião. , Contudo, encontraram uma associação forte entre um genótipo específico (Lysine-627 na proteína básica da polimerase do vírus) e anfitriões mamíferos no campo.
“Quando este genótipo não for exclusivo aos mamíferos, nós pensamos que é importante seguir como esta mutação particular está espalhando porque parece ser tão infeccioso e mortal nos ratos,” diz Janies.