鸟流感病毒新的交互选择映射显示传播

这里科学家设计了鸟流感病毒 (H5N1) 的传播的新，交互选择映射第一次合并基因，地理和演变信息可能帮助预测病毒的下爆发哪里可能发生。

在这个进程中，他们也检验关于看上去朝向向西并且有这个能力传染人病毒特定亚型的本质的假设。

生物医学的专家小组，导致由丹尼尔 Janies，生物医学的信息学，使用的特殊软件的部门的一位助理教授创建病毒的变化的一个演变结构树。 他们在 Google Earth 使用匙孔标记语言设想在这个地球上的结构树然后选择颜色和符号指示带有病毒的不同的主机，并且他们哪里居住。 时间范围，在 Google Earth 的另一个功能，给他们在过去十年中给病毒的传播赋予生命。

映射是塞满附加信息。 点击在特定病毒子型生成显示与别的区分病毒一种亚型的诊断变化的一弹出式视窗，并且所有数据与国家卫生研究所 GenBank 被链接。

“映射产生我们看见在活动的病毒一个全部的新的方式，并且了解什么是和不执行”， Janies 说。 “它使我们对关于来自实验室研究 H5N1 的传播的已存在的假说比较关于病毒的发现在现实世界”。

这个研究出现在系统的生物的 4月问题的在线本周。

鸟流感病毒在野生水禽首先被认可了在广东，在 1996年中国。 它然后分布给鸡和人在香港来年。 从 1997年直到 2005年，它在几个东南亚国家(地区) 涌现了和传播通过多个主机遍及中央和南中国、俄罗斯、中东和印度。 迄今，另外的爆发报告了作为远西部作为欧洲和非洲和作为远东作为日本、韩国和印度尼西亚。

在创建 supermap，研究员学习了从病毒的 351 孤立的基因数据。 他们是特别对发现感兴趣某些主机是否运载，并且病毒运载特定变化启用传输对人病毒的特定表单。

“我们发现信息多个层的形象化非常有用在生成我们可能通过对变化数据的统计分析检验我们在这个演变结构树组织的假设”， Janies 说。 “发现帮助我们了解看上去与某些主机或地理区域相关的变化是否偶然出现，或者他们是否是病毒的真的适应，因为它分布”。

流感病毒根据几个标准被分类： 他们是否来自动物或人和坐病毒、 hemaglutinin 和神经氨酸苷酶的表面二关键蛋白质 (HA)的活动 (NA)。 HA 帮助病毒 “棍子”对寄主细胞并且传染它; NA 帮助病毒从这个细胞逃脱和分布到其他细胞和主机。 以前，科学家假设，如果病毒的亚型涌现了该被启用的人对人传染的传输，它在这两蛋白质很可能将介入变化。

Janies 和他的同事没有查找任何基因型与在显著与主机相关的任何特定类型的这两表面蛋白质的变化相关。 然而，他们查找了在一个特定基因型 (赖氨酸627 在病毒的聚合酶基本的蛋白质) 和哺乳动物的主机之间的严格的关联在这个域。

“而此基因型不是独有的对哺乳动物，我们认为跟踪是重要的此特殊变化如何分布，因为看起来是很传染性和致命的在鼠标”，说 Janies。

此刻，看来 H5N1 病毒不是高度可表达的对人或在人之间。 但是那能迅速更改。 科学家说涌现，无法预测的变化可能装备病毒与什么它需要更加灵活地跳在种类之间，并且专家说大流行病是惨败的。 疾病控制预防中心估计 15% 到 35% 的人口在美国可能变得传染在范围从 $71 十亿的费用到 $166 十亿。

根据世界卫生组织，充电与跟踪 H5N1 数据，有疾病的 291 个案件在人的从最初的爆发和 172 死亡。

Janies 说 supermap 是普遍可适用的在跟踪传染物质传播，补充说，他的组在映射其他疾病已经从事，例如 SARS。 他注意那尽管最近工作成绩刺激协作，并且所有数据的发行关于 H5N1 病毒的，巨大数量的基因组信息在专用现有量依然是。 单独，平均值现行对照是未完成的，最好。 他也注意到，当有好数据在一定数量的公共数据库中时，那些基因顺序没有附注与关于主机种类的信息，他们是否是通配或国内的，例如。

但是， supermap 可能提供调查员一个新颖的方式共享关于新的爆发的信息和预测公共卫生官员哪里需要迅速操作开始对抗措施。 在 2004年 “有一个有趣案件，其中一些被传染的老鹰从泰国非法走私向比利时”，说 Janies。 “当鸟迅速被限制了时，并且病毒那时没有分布，那些案件出现了作为一个清楚的反常现象在我们的映射，反射非法贸易允许病毒做一个巨大的地理飞跃的例程”。

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