鳥流感病毒新的交互選擇映射顯示傳播

這裡科學家設計了鳥流感病毒 (H5N1) 的傳播的新，交互選擇映射第一次合併基因，地理和演變信息可能幫助預測病毒的下爆發哪裡可能發生。

在這個進程中，他們也檢驗關於看上去朝向向西并且有這個能力傳染人病毒特定亞型的本質的假設。

生物醫學的專家小組，導致由丹尼爾 Janies，生物醫學的信息學，使用的特殊軟件的部門的一位助理教授創建病毒的變化的一個演變結構樹。 他們在 Google Earth 使用匙孔標記語言設想在這個地球上的結構樹然後選擇顏色和符號指示帶有病毒的不同的主機，并且他們哪裡居住。 時間範圍，在 Google Earth 的另一個功能，給他們在過去十年中給病毒的傳播賦予生命。

映射是塞滿附加信息。 點擊在特定病毒子型生成顯示與別的區分病毒一種亞型的診斷變化的一彈出式視窗，并且所有數據與國家衛生研究所 GenBank 被鏈接。

「映射產生我們看見在活動的病毒一個全部的新的方式，并且瞭解什麼是和不執行」， Janies 說。 「它使我們對關於來自實驗室研究 H5N1 的傳播的已存在的假說比較關於病毒的發現在現實世界」。

這個研究出現在系統的生物的 4月問題的在線本週。

鳥流感病毒在野生水禽首先被認可了在廣東，在 1996年中國。 它然後分佈给雞和人在香港來年。 從 1997年直到 2005年，它在幾個東南亞國家(地區) 湧現了和傳播通過多個主機遍及中央和南中國、俄羅斯、中東和印度。 迄今，另外的爆發報告了作為遠西部作為歐洲和非洲和作為遠東作為日本、韓國和印度尼西亞。

在創建 supermap，研究員學習了從病毒的 351 孤立的基因數據。 他們是特別對發現感興趣某些主機是否運載，并且病毒運載特定變化啟用傳輸對人病毒的特定表單。

「我們發現信息多個層的形象化非常有用在生成我們可能通過對變化數據的統計分析檢驗我們在這個演變結構樹組織的假設」， Janies 說。 「發現幫助我們瞭解看上去與某些主機或地理區域相關的變化是否偶然出現，或者他們是否是病毒的真的適應，因為它分佈」。

流感病毒根據幾個標準被分類： 他們是否來自動物或人和坐病毒、 hemaglutinin 和神經氨酸苷酶的表面二關鍵蛋白質 (HA)的活動 (NA)。 HA 幫助病毒 「棍子」對寄主細胞并且傳染它; NA 幫助病毒從這個細胞逃脫和分佈到其他細胞和主機。 以前，科學家假設，如果病毒的亞型湧現了該被啟用的人對人傳染的傳輸，它在這兩蛋白質很可能將介入變化。

Janies 和他的同事沒有查找任何基因型與在顯著與主機相關的任何特定類型的這兩表面蛋白質的變化相關。 然而，他們查找了在一個特定基因型 (賴氨酸627 在病毒的聚合酶基本的蛋白質) 和哺乳動物的主機之間的嚴格的關聯在這個域。

「而此基因型不是獨有的對哺乳動物，我們認為跟蹤是重要的此特殊變化如何分佈，因為看起來是很傳染性和致命的在鼠標」，說 Janies。

此刻，看來 H5N1 病毒不是高度可表達的對人或在人之間。 但是那能迅速更改。 科學家說湧現，無法預測的變化可能裝備病毒與什麼它需要更加靈活地跳在種類之間，并且專家說大流行病是慘敗的。 疾病控制預防中心估計 15% 到 35% 的人口在美國可能變得傳染在範圍從 $71 十億的費用到 $166 十億。

根據世界衛生組織，充電與跟蹤 H5N1 數據，有疾病的 291 個案件在人的從最初的爆發和 172 死亡。

Janies 說 supermap 是普遍可適用的在跟蹤傳染物質傳播，補充說，他的組在映射其他疾病已經從事，例如 SARS。 他注意那儘管最近工作成績刺激協作，并且所有數據的發行關於 H5N1 病毒的，巨大數量的基因組信息在專用現有量依然是。 單獨，平均值現行對照是未完成的，最好。 他也注意到，當有好數據在一定數量的公共數據庫中時，那些基因順序沒有附註與關於主機種類的信息，他們是否是通配或國內的，例如。

但是， supermap 可能提供調查員一個新穎的方式共享關於新的爆發的信息和預測公共衛生官員哪裡需要迅速操作開始對抗措施。 在 2004年 「有一個有趣案件，其中一些被傳染的老鷹從泰國非法走私向比利時」，說 Janies。 「當鳥迅速被限制了時，并且病毒那時沒有分佈，那些案件出現了作為一個清楚的反常現象在我們的映射，反射非法貿易允許病毒做一個巨大的地理飛躍的例程」。

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