同樣，對細胞的生理環境的更改，與藥物或毒素，例如，可能修改他們新陳代謝的輸出。 要跟蹤這些進程，科學家需要方式標記基因和他們的蛋白質產品。 本月的版本冷彈簧港口協議 (www.cshprotocols.org) 以標記的分子免費可得的方法為特色識別基因改變和新陳代謝的班次。
第一個方法 (http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/10/pdb.prot4743) 描述如何生長從細菌、酵母、昆蟲或者哺乳動物的細胞在包含穩定同位素氮氣15 的媒體。 當細胞增長，他們生產包括氮氣15 的出生蛋白質，與已存在那些區分新形成的新陳代謝的產品的標記。 在這些細胞和 「正常」細胞之間的區別 (增長在媒體，不用氮氣15) 可能然後被定量使用稱質譜分析的技術。
要識別結構上的功能和反常性在染色體，科學家需要用視覺標記標記脫氧核糖核酸探測。 第二個免費可得的方法 (http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/10/pdb.prot4730) 描述如何標記與六個不同顏色螢光標記的脫氧核糖核酸探測，跨過這個可見光譜。 這些在魚 (螢光在原處雜交) 實驗標記了脫氧核糖核酸探測可以同時使用，在期間探測束縛對特定染色體地區利益。 五顏六色的染色體可能然後被查看在顯微鏡下。
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