新しいマッピング技術は、染色体の構造に関する基本的な質問にお答えします

イリノイ大学の研究者は、イメージングとマッピングショウジョウバエの染色体のためのシンプルで経済的な手法を開発した。

この新しいアプローチは、染色体の最初の正確な地図を構築し、その縞模様に隠された秘密を引き出すことができるようになります。

彼らの作品は、Nature誌の方法で出版物の事前年5月6日オンラインで表示されます。

それらの細胞の一部は巨大な、"多糸"染色体、DNA鎖の1,000以上の並列コピーで構築されたそれぞれを含んでいるため、ミバエはよく染色体の研究に適しています。汚された、凝縮、濃いバンドと軽い地域は、（interbands）染色体の縞模様の外観を与えるときに。

70年以上の場合は、cytogeneticistsは果物のバンドの手描きマップを使用しているだけ漠然と線引きこれらの構造体の形状と位置で、多糸染色体を飛ぶ。このマップは、最初1935年に出版され、光と電子顕微鏡の世代の染色体の不正確なガイドが得られている。

染色体の準備の伝統的な方法は、バンドとinterbandsは、基礎となる遺伝子配列に関連付ける方法を整理することを望んでそれらのための限られた有用性を持つ、新しいテクニックを開発し、細胞および発生生物学研究の専門家ドミトリノビコフは、言った。ショウジョウバエ、キイロショウジョウバエのゲノムは2000年にシークエンシング、および、まだ染色体の構造との関係は不明なまました。

"我々は生きているシステムでは異なる構造の開発に関与しているかの遺伝子、これを見て最初の構造体であるかを知りたいので、"ノビコフは言った。 "これが出発点です：遺伝子そのものの外観。"

細胞および発生生物学の教授とモスクワ国立大学の主任研究員アンドリューS. Belmontと客員研究員イゴールKireevは、論文の共同執筆者です。ベルモントでは、ゲノム生物学と生物物理学と計算生物学研究センターのためにI.研究所のU.です。

光顕微鏡で見るために多糸細胞を調製するための現在の方法は、カバーガラスとスライドの間に細胞を操縦し、押して親指、鉛筆、鉗子または他の楽器を使用して、。この方法が使用可能な画像を提供し、さらにそれらのまれに鮮明な構造の詳細を提供する処理のスライドを約10％しか、ノビコフは言った。

セルを広げるとフラット化する機械装置の使用、および同染色体の数百の例を分析するための処理、コンピュータベースのイメージの適用：新しいアプローチの2つのコンポーネントが含まれています。分析するために非常に多くの鮮明な画像で、コンピュータのアルゴリズムは正確数、形状および染色体のバンドの位置を計算することができます。

"2人の研究者が異なる同じ画像が表示される場合があります、"画像を分析するベックマン研究所教授トーマス黄の監督の下、コンピュータビジョン技術を使用している大学院での研究アシスタントMert Dikmenは言った。 "我々のシステムは、バンドの位置の公平な見積もりを与える。それは研究者に依存することはありません。それは客観的になる。"

染色体の拡散を改善するために、研究者は数分間カバーの表面を振動回転工具を使用してください。単純な機械的な万力は非常に薄く、コントラストの高い調剤をレンダリングする、各スライドに力2トンにまで適用されます。これは、はるかに明確の生産、情報満載の画像が可能になります。

技術は他の利点があります：それは、光学顕微鏡に依存するため、それは同等または優れた結果を、より速く、電子顕微鏡よりも経済的です。

より正確な染色体地図と、研究者は、次の特定のDNA配列に結合する蛋白質の蛍光免疫染色を使用します。これらのランドマークには、それらが物理的な構造にシーケンスの関係を引き出すのに役立ちます。

新しいアプローチは、科学者は染色体の構造に関する基本的な質問に答えることを可能にする、ノビコフは言った。このような質問は、種間の関連性を持っている。

http://www.uiuc.edu