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Variação estrutural no genoma humano

Published on May 10, 2007 at 12:31 PM · No Comments

Um grande esforço para descobrir novas as diferenças de médio e grande escala genéticas entre os seres humanos podem em breve revelar seqüências de DNA que contribuem para uma ampla gama de doenças, de acordo com um artigo de Howard Hughes Medical Institute investigador Evan Eichler e 17 colegas publicaram em maio 10, de 2007, a Natureza.

O empreendimento vai ajudar os pesquisadores a identificar variações estruturais nas seqüências de DNA, que Eichler diz montante a tanto como cinco a dez por cento do genoma humano.

Estudos anteriores da humana diferenças genéticas normalmente têm-se centrado nas letras individuais ou bases de uma seqüência de DNA. Mas as diferenças genéticas entre seres humanos quantidade a mais de erros de ortografia simples. "As mudanças estruturais - inserções, duplicações, deleções e inversões de DNA - são extremamente comuns na população humana", diz Eichler. "Na verdade, bases mais estão envolvidos em mudanças estruturais no genoma que estão envolvidos em um único par de base de mudanças."

Em alguns casos, os genes individuais aparecem em múltiplas cópias por causa de duplicações de segmentos de DNA. Em outros casos, segmentos de DNA aparecem em algumas pessoas, mas não outros, o que significa que o "genoma humano de referência produzido pelo Projeto Genoma Humano é incompleto." Estamos descobrindo nova seqüência do genoma humano que não está na seqüência de referência ", diz Eichler.

Essas mudanças estruturais podem influenciar tanto a susceptibilidade à doença e ao normal funcionamento e aparência do corpo. Daltonismo, aumento do risco de câncer de próstata, e susceptibilidade a algumas formas de doenças cardiovasculares resultado de deleções de genes específicos ou partes de genes. Cópias extras de um gene conhecido como CC3L1 reduzir a susceptibilidade de uma pessoa à infecção pelo HIV e progressão para AIDS. Inferior a quantidade normal de outros genes pode levar a doenças intestinais ou renais.

Variação no número de genes ou na regulação dos genes causada por rearranjos estruturais também podem contribuir para doenças mais comuns. "A pergunta do milhão de dólares é o que é a base genética de doenças como diabetes, hipertensão e altos níveis de colesterol", diz Eichler. "Sabemos que existe um fator genético, mas qual é o papel das mudanças único par de base versus mudanças estruturais".

O projeto Eichler e seus colegas descrevem em seu artigo irá ajudar a responder esta pergunta. Usando o DNA de 62 pessoas que foram estudados como parte do Projeto Internacional HapMap, que estão criando bacteriana "bibliotecas de segmentos de DNA para cada pessoa. As extremidades dos segmentos são então seqüenciados para descobrir evidências de variação estrutural. Sempre que tal evidência é encontrada, o segmento de DNA inteiro é seqüenciado para catalogar todas as diferenças genéticas entre o segmento ea seqüência de referência.