Het blijkt er meer dan één manier is om een gen te villen. Het Nieuwe onderzoek van Universiteit Rockefeller brengt naar voren dat twee nauw verwante unpackaging mechanismen van DNA de gedachte van manierwetenschappers kunnen niet werken.
De Toegang tot een gen vereist een gastheer van proteïnen in achter elkaar werken om beschermende chromatin van open DNA los te krijgen shell, die door complexen van DNA en speciale verpakkende proteïnen genoemd wordt gevormd histones. Het Onderzoek naar het Laboratorium van David Allis's van Chromatin Biologie en Epigenetics concentreert zich bij het begrip van chemische wijzigingen aan de threadlike eiwit „Staarten die van histones hangen. Maar twee van deze gen-activerende wijzigingen, die chemische groepen methyl genoemd en ubiquitin aan de aminozuurlysine bij specifieke plaatsen op naburige histones toevoegen, zijn slecht begrepen. Minstens, waren zij.
Het Vroege onderzoek door het laboratorium van Allis stelde vast dat deze twee wijzigingen functioneel verwant zijn. De Experimenten toonden aan dat de veranderingen in gist die ubiquitylation ook afschafte tot verlies van methylation leidden. Omdat ubiquitylation bij lysine 119 op één type van histone plaatsvindt, riep H2B, en methylation vindt bij lysine 4 op een andere histone plaats, stelde H3, het vinden voor dat de wijzigingen op verschillende histones met elkaar in een type van signalerende weg communiceren. Maar de vragen bleven nog over de functie van elk van deze wijzigingen in transcriptieactivering.
Jason Tanny, een postdoc in het laboratorium van Allis, en zijn collega's beantwoorden sommige van deze vragen in een dekkingsartikel in de kwestie van April van Genen en Ontwikkeling. Tanny, eerste auteur van het rapport, trachtte te bepalen of ubiquitylation en methylation functioneel gelijkwaardig zijn.
Gebruikend splitsingsgist als model, leidde Tanny tot een verandering in histone H2B die zijn ubiquitylationplaats op lysine 119 elimineerde, en vond dat methylation op H3 ook geschaad was, bevestigend het verband tussen de twee wijzigingen. Hij vond ook dat de cellen met tekorten in ubiquitylation ongezond werden: De cellen van de mutantgist groeiden langzamer dan hun normale zustercellen.
„Als de cellen ziek zijn, zou het zijn omdat u deze weg elimineert dat de lood van ubiquitylation aan methylation, „Tanny zegt. 'dachten wij zo dat het elimineren van methylation ook de cellen.“ ziek zou maken Maar toen Tanny uit klopte riep een gen set1, die methylation op H3 afschafte zonder ubiquitylation op H2B te beïnvloeden, de normale celgroei was intact. Zo H2B ubiquitylation functioneerde stroomopwaarts van lysineH3 methylation. Tanny redeneerde dat ubiquitylation in een afzonderlijke weg werkte en de celgroei beïnvloedde.
Tanny gebruikte een chromosoomimmunoprecipitation analyse om te bepalen waar de polymerase van RNA, de grote eiwitmachine die DNA in RNA kopieert, in deze genen wordt gevestigd. Hij vond dat de polymerase van RNA geen probleem had dat aan de genpromotor krijgt, de eerste stap in transcriptie, maar er waren problemen stroomafwaarts, bij het lichaam van het gen.