Lumiliko out may higit sa isang paraan upang balat ng isang gene. Bagong pananaliksik mula sa Rockefeller University nagmumungkahi na ang dalawang malapit na nauugnay DNA unpackaging mekanismo ay maaaring hindi gumana ang paraan na siyentipiko naisip.
Access sa isang gene ay nangangailangan ng isang host ng mga proteins magtrabaho sa magkasunod sa sikwatin proteksiyon buksan ang DNA ng chromatin shell, na nabuo sa pamamagitan ng complexes ng DNA at mga espesyal na mga packaging proteins na tinatawag histones. Research sa David Allis ng Laboratory ng Chromatin Biology at Epigenetics tumutuon sa pag-unawa pagbabago kemikal sa ang may hugis ng sinulid protina "Tails na hang mula sa histones. Subalit dalawang ng mga gene-activate pagbabago, na kung saan idagdag group kemikal na tinatawag na metil at ubiquitin ang amino acid lysine sa tiyak na lokasyon sa kalapit histones, ay mahina naiintindihan. Hindi bababa sa, sila ay.
Maagang pananaliksik sa pamamagitan ng Allis ng lab na itinatag na ang dalawang pagbabago na ito ay functionally kaugnay. Eksperimento ay nagpakita na ang mga mutations sa lebadura na buwag ubiquitylation ring humantong sa pagkawala ng methylation. Dahil ubiquitylation tumatagal ng lugar sa lysine 119 sa isang uri ng histone, na tinatawag na H2B, at methylation ay tumatagal ng lugar sa lysine 4 sa isa pang histone, H3, paghahanap ang iminungkahing na ang mga pagbabago sa iba't ibang histones makipag-ugnayan sa bawat isa sa isang uri ng pagbibigay ng senyas ng pathway. Subalit ang tanong ay pa rin ang nanatiling tungkol sa mga function ng bawat isa sa mga pagbabago sa pagkakakopya activation.
Jason Tanny, isang postdoc sa Allis ng laboratoryo, at ang kanyang mga kasamahan ang answer sa ilang mga tanong na ito sa isang artikulo ng cover sa Abril isyu ng mga Genes at Development. Tanny, ang unang may-akda ng ulat, na nakatakda upang matukoy kung ubiquitylation at methylation ay functionally katumbas.
Gamit ang fission pampaalsa bilang isang modelo, nilikha Tanny isang pagbago sa histone H2B na knocked out nito ubiquitylation site sa lysine 119, at natagpuan na ang methylation sa H3 ay din kapansanan, na nagpapatunay sa relasyon sa pagitan ng dalawang pagbabago. Din niya natagpuan na ang mga cell na may mga depekto sa ubiquitylation naging masama sa katawan: Ang mutant pampaalsa cell lumago nang mas mabagal kaysa sa kanilang normal na mga cell ng kapatid na babae.
"Kung ang mga cell ay may sakit, ito ay dahil ikaw ay katok ito pathway na lead mula sa ubiquitylation sa methylation," sabi ni Tanny. 'Upang naisip namin na katok methylation ay ring gumawa ng mga cell ng sakit. "Ngunit kapag Tanny knocked out ng isang gene tinatawag set1, na buwag methylation sa H3 nang hindi naaapektuhan ang ubiquitylation sa H2B, normal na cell paglago ay unimpaired. So H2B ubiquitylation ay gumagana pasalungat sa agos ng lysine H3 methylation. Tanny reasoned ubiquitylation na operating sa isang hiwalay na landas at nakakaapekto sa cell paglago.
Tanny gumamit ng isang baso immunoprecipitation ng kromosoma upang matukoy kung saan ang RNA polymerase, ang malaking machine protina na kopya ng DNA sa RNA, ay matatagpuan sa mga genes. Nahanap niya na ang RNA polymerase ay walang problema sa pagkuha sa gene tagataguyod, ang unang hakbang sa pagkakakopya, ngunit may mga problema sa ibaba ng agos, sa katawan ng gene.