Den vänder ut där är mer än en långt som flår en gen. Ny forskning från den Rockefeller Universitetar föreslår att två nära släkta unpackaging mekanism för DNA inte kan fungera långt forskaretanken.
Ta Fram till en gen kräver en vara värd av proteiner att fungera i tandemcykel för att bända upp öppen DNAS skyddande chromatin beskjuter, bildat av komplex av DNA och sakkunniga som paketerar proteiner som kallas histones. Forska i det David Alliss Laboratoriumet av ChromatinBiologi, och Epigenetics fokuserar på kemiska ändringar för överenskommelse Svanar till för det threadlike proteinet ”den hängning från histones. Men två av dessa gen-aktivera ändringar, som tillfogar kemiska grupper som kallas methyl och ubiquitinen till den amino syrliga lysinen på specifika lägen på neighboring histones, förstås dåligt. Åtminstone var de.
Tidig sortforskning vid etablerade Alliss labb som dessa två ändringar är funktionellt släkta. Experiment visade att mutationar i jäst, som avskaffade ubiquitylation också ledde till förlust av methylation. Därför Att ubiquitylationen äger rum på lysine 119 på en typ av histonen som kallas H2B och methylation, äger rum på lysine 4 på en annan histone, H3, finna möjligt att ändringar på olika histones meddelar med varje annan i en typ av signalerandebanan. Men ifrågasätter fortfarande återstående om fungera av varje av dessa ändringar i transkriptionaktivering.
Jason Tanny, en postdoc i Alliss laboratorium och hans kollegor svarar att några av dessa ifrågasätter i en täckaartikel i April utfärdar av Gener och Utveckling. Tanny, den första författare av rapporten, uppsättningen ut som huruvida bestämmer ubiquitylation, och methylation är funktionellt likvärdigt.
Genom Att Använda fissionjäst som en modellera, skapade grundar Tanny en mutation i histonen H2B, som knackade ut dess ubiquitylationplats på lysine 119, och att methylation på H3 försämrades som också bekräftar förhållandet mellan de två ändringarna. Han grundar också att cellerna med hoppar av i ubiquitylation blev sjukliga: Mutantjästcellerna växte långsammare än deras det normalasysterceller.
”Om cellerna är sjuka, skulle den är, därför att du knackar ut denna bana, som leder från ubiquitylation till methylation, ”något att säga Tanny. 'så tänkte vi att knacka ut methylation som också skulle gör cellerna sjuka.”, Men, då Tanny knackade ut en gen som kallades set1, som avskaffade methylation på H3 utan röra ubiquitylation på H2B, var det normalacelltillväxt unimpaired. Så fungerade H2B-ubiquitylationen upstream av methylation för lysine H3. Tanny resonerade att ubiquitylationen fungerade i en separat bana och en röra celltillväxt.
Tanny använde en kromosomimmunoprecipitationanalys för att bestämma var RNApolymerasen, det stora proteinet bearbetar med maskin, som kopierar DNA in i RNA, lokaliseras i dessa gener. Han grundar, att RNApolymerasen hade inget problem att få till gentillskyndaren, första steg i transkription, men det fanns problem downstream, på förkroppsliga av genen.