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對 ubiquitylation 的新的瞭解

Published on May 10, 2007 at 1:41 PM · No Comments

它結果那裡是超過一種方式剝皮基因。 從洛克菲勒大學的新的研究建議二個密切相關的脫氧核糖核酸 unpackaging 的結構可能不運作方式科學家想法。

對基因的存取要求許多蛋白質一前一後運轉撬起開放脫氧核糖核酸的防護染色質殼,形成由稱組蛋白的脫氧核糖核酸和特殊包裝的蛋白質複雜。 研究在染色質生物和 Epigenetics 大衛 Allis 的實驗室著重瞭解對從組蛋白停止的絲狀蛋白質的化工修改 「尾標。 但是二這些基因激活的修改,添加化工組稱甲基和 ubiquitin 到氨基酸賴氨酸在相鄰的組蛋白的特定地點,很難懂。 至少,他們是。

由 Allis 的實驗室的早期的研究設立這兩修改是功能上相關的。 實驗向顯示在也廢除 ubiquitylation 的酵母的變化導致了甲基化損失。 由於 ubiquitylation在組蛋白的一種類型的賴氨酸 119 進行,稱 H2B 和甲基化在另一組蛋白的賴氨酸 4, H3,查找進行被建議在不同的組蛋白的修改與彼此聯絡在信號路的類型。 但是問題仍然依然是關於這些修改中的每一的功能在副本啟動。

賈森 Tanny、 postdoc 在 Allis 的實驗室和他的同事在一個封面文章上回答其中一些問題在基因和發展的 4月問題。 Tanny,報表的第一個作者,開始確定 ubiquitylation 和甲基化是否是功能上相同的。

使用分裂酵母作為設計, Tanny 在擊倒其賴氨酸的 119 ubiquitylation 站點的組蛋白 H2B 創建了一個變化,并且發現也削弱了在 H3 的甲基化,確認二修改之間的關係。 他也發現細胞以在 ubiquitylation 的缺陷變得不健康: 突變體酵母細胞比他們的正常姐妹細胞遲緩地增長。

「如果細胞是病態的,它是,因為您擊倒從 ubiquitylation 導致甲基化的此路, 「說 Tanny。 『如此我們認為擊倒甲基化也將使細胞病態」。 但是,當 Tanny 擊倒了稱 set1 的基因,廢除在 H3 的甲基化,无需影響在 H2B 的 ubiquitylation,正常細胞增長是未受損傷的。 因此 H2B ubiquitylation 發揮作用逆流賴氨酸 H3 甲基化。 Tanny 原因 ubiquitylation 在一條單獨路運行并且影響細胞增長。

Tanny 使用染色體免疫沉澱反應檢驗確定核糖核酸聚合酶,複製脫氧核糖核酸到核糖核酸的大蛋白質設備,哪裡位於這些基因。 他發現核糖核酸聚合酶沒有問題有基因促進者,在副本的第一步,但是有問題順流,在這個基因的機體。

「ubiquitylation 變化的實際作用對副本在核糖核酸聚合酶的能力獲得通過這個基因,而不是核糖核酸聚合酶的能力有基因首先」, Tanny 說。 「這建議我們看到的原因在這些突變體的基因表達缺陷是,因為有副本伸長缺陷在特定基因」。

Nucleosomes 表示障礙對副本,試管研究向顯示 nucleosomes 需要在某個方面被打亂為了核糖核酸聚合酶能通過有脫氧核糖核酸。 科學家認為副本繼續進行,當 nucleosomes 拆散一起然後放回,在核糖核酸聚合酶經歷後。 Tanny 建議 ubiquitylation 直接地影響 nucleosome 集合,當核糖核酸聚合酶經歷。

「由於這些修改從酵母很被保存到人,這是重要對 nucleosome 結構如何在副本時被修改」, Tanny 的瞭解的結構說。

「賈森的工作顯示出,組蛋白 ubiquitylation 在核糖核酸聚合酶伸長扮演作用,當基因存在於染色質橫向時,可以是分別於在標記的其他染色質嚴密地發揮作用與副本啟動」,說 Allis,是喜悅和傑克 Fishman 教授的功能。 「知道這如何發生機構可能將是其中一個在蛋白質 ubiquitylation 的下個扣人心弦的章節」。

http://www.rockefeller.edu