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Wissenschaftler konvertieren die Reihenfolge von Proteinen in Musik

Published on May 17, 2007 at 9:25 PM · No Comments

UCLA-Molekularbiologen haben Proteinsequenzen zu Originalkompositionen der klassischen Musik gemacht.

„Wir konvertierten die Reihenfolge von Proteinen in Musik und können ein Gehörsignal für jedes Protein erhalten,“ sagte Jeffrey H. Miller, bemerkenswerter Professor von Mikrobiologie, Immunologie und Molekulargenetik und Bauteil des Molekularbiologie-Instituts UCLAS. „Jedes Protein hat seine eindeutige Gehörunterzeichnung, weil jedes Protein eine eindeutige Reihenfolge hat. Sie können die Reihenfolge des Proteins hören.“

„Wir wiesen eine Spannweite jeder Aminosäure zu,“ sagte Rie Takahashi, ein UCLA-wissenschaftlicher Mitarbeiter und einen award-winning, klassisch ausgebildeten Klavierspieler. „Wir möchten sehen, wenn wir Muster innerhalb der Musik, im Gegensatz zu dem Betrachten der Schreiben einer Aminosäure oder der Proteinsequenz hören können. Wir können zu einem Protein, im Gegensatz zu es gerade betrachten hören.“

Die Bausteine von Proteinen sind lineare Reihenfolgen von 20 verschiedenen Aminosäuren. Die Zuordnung von einer Anmerkung für jede Aminosäure ergibt deshalb eine Schuppe mit 20 Anmerkungen.

„Eine Schuppe mit 20 Anmerkungen ist eine zu große Reichweite,“ sagte Takahashi. „Sie benötigen eine verringerte Schuppe, also passten wir ähnliche Aminosäuren zusammen zusammen und verwendeten Spannweiten und Spannweitenvarianten für jede Aminosäure. Wir verwendeten jedes Bauteil der Musik, um eine spezifische Eigenschaft des Proteins anzuzeigen. Wir sind in der Umwandlung von der Reihenfolge zur Musik zuverlässig. Der Rhythmus wird vorgeschrieben durch die Proteinsequenz.“

Auf der Site der Biologen (www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/examples.html), können Sie zu den Kompositionen hören und sogar Ihre eigene Gensequenz eingeben und sie übertragen lassen zur Musik. Die Datenbanksuchroutine lässt jedermann in eine Reihenfolgenkodierung für ein Protein senden, das dann in Musik konvertiert wird und als MIDI-Audiofeile zurückgebracht. Die Forschung wird in der Genom-Biologie, ein bedeutender Zapfen auf dem Gebiet von Genomics veröffentlicht.

„Ich dachte an das Handeln eines Projektes so für Jahre,“ sagte Miller, „aber verwirklichte, dass I eine Person benötigte, die die eindeutigen Eigenschaften des Seins ein molekularer Genetiker und ein ernster klassischer Musiker hat. Als Ich Rie traf, verwirklichte Ich, dass dieses die Person ist, die Ich habe gesucht.“

Takahashi war ein UCLA-Nichtgraduierter in der Mikrobiologie, in der Immunologie und in der Molekulargenetik, die die Forschung als Ehrenthese taten.

„Viele Wissenschaftler mögen klassische Musik,“ sie beachteten. „Bevor Ich einen Kurs von Dr. Miller nahm, waren jene zwei Welten in meinem Kopf unterschiedlich. Zu die zwei zu überbrücken ist sehr befriedigend. Mein Klavierlehrer hat keinen Wissenschaftshintergrund, aber, wenn Ich Musik verwende, um Proteine ihm zu erklären, geht sie vom Kauderwelsch zu etwas, das interessiert ihn wirklich.“

Takahashi und Miller sind nicht die ersten Wissenschaftler, zu versuchen, Proteinsequenzen in Musik zu konvertieren, aber sie glauben, dass ihre Musik und weniger „nervös“ als vorhergehende Versuche melodischer ist. Zuerst konvertierte Takahashi die Aminosäuren und spielte die resultierende Musik auf dem Klavier. Jetzt steuern sie ein Computerprogramm, geschrieben vom Kollegen Frank Pettit, der ihre Übersetzungsregeln verwendet, um die Proteinsequenzen in Musik zu konvertieren. Sie hoffen, dass dieses die Übersetzung von großen Abschnitten von Genomen beschleunigt.