I biologi molecolari del UCLA hanno trasformato le sequenze della proteina nelle composizioni originali di musica classica.
“Abbiamo convertito la sequenza delle proteine in musica e possiamo ottenere un segnale uditivo per ogni proteina,„ ha detto Jeffrey H. Miller, il professor distinto di microbiologia, l'immunologia e la genetica molecolare e un membro dell'Istituto della Biologia Molecolare del UCLA. “Ogni proteina avrà sua impronta uditiva unica perché ogni proteina ha una sequenza unica. Potete sentire la sequenza della proteina.„
“Abbiamo definito una corda ad ogni amminoacido,„ ha detto Rie Takahashi, un assistente di ricerca del UCLA e un giocatore di piano premiato e classicamente formato. “Vogliamo vedere se possiamo sentire i reticoli all'interno della musica, rispetto ad esaminare le lettere di una sequenza della proteina o dell'amminoacido. Possiamo ascoltare una proteina, rispetto appena ad esaminarla.„
Le particelle elementari delle proteine sono le sequenze lineari di 20 amminoacidi differenti. Definendo una nota per ogni amminoacido quindi provoca un disgaggio di 20 note.
“Un disgaggio di 20 note è un intervallo troppo vasto,„ Takahashi ha detto. “Avete bisogno di un disgaggio diminuito, in modo da abbiamo accoppiato insieme i simili amminoacidi ed abbiamo usato le corde e le variazioni della corda per ogni amminoacido. Abbiamo usato ogni componente della musica per indicare una caratteristica specifica della proteina. Siamo fedeli nella conversione dalla sequenza alla musica. Il ritmo è dettato dalla sequenza della proteina.„
Sul sito dei biologi (www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/examples.html), potete ascoltare le composizioni e perfino presentare la vostra propria sequenza genetica e farlo tradurre a musica. Il browser permette che chiunque introduca una codifica di sequenza per una proteina, che poi sarà convertita in musica e sarà restituita come file audio del MIDI. La ricerca è pubblicata nella Biologia del Genoma, un giornale importante nel campo di genomica.
“Stavo pensando a fare un progetto come questo per anni,„ Miller ha detto, “ma ha realizzato che la I ha avuto bisogno di una persona che ha le caratteristiche uniche di essere sia un genetista molecolare che un musicista classico serio. Quando ho incontrato Rie, ho realizzato che questa è la persona sto cercando.„
Takahashi era uno studente non laureato del UCLA nella microbiologia, nell'immunologia e nella genetica molecolare che che hanno effettuato la ricerca come tesi di onori.
“Molti scienziati gradiscono la musica classica,„ lei hanno notato. “Prima Che catturi un corso dal Dott. Miller, quei due mondi erano separati nella mia mente. Per gettare un ponte sui due è molto rewarding. Il Mio insegnante di piano non ha uno sfondo di scienza, ma quando uso la musica per spiegare le proteine a lui, va da linguaggio incomprensibile a qualcosa che realmente lo interessi.„
Takahashi e Miller non sono i primi scienziati da tentare di convertire le sequenze della proteina in musica, ma credono che la loro musica sia più melodica e più di meno “nervoso„ che i tentativi precedenti. Inizialmente, Takahashi ha convertito gli amminoacidi ed ha giocato la musica risultante sul piano. Ora stanno pilotando un programma informatico, scritto dal collega Frank Pettit, che usa le loro norme di traduzione per convertire le sequenze della proteina in musica. Sperano che questo acceleri la traduzione di grandi segmenti dei genoma.