Os biólogos moleculars do UCLA transformaram seqüências da proteína em composições originais da canção clássica.
“Nós convertemos a seqüência das proteínas na canção e podemos obter um sinal auditivo para cada proteína,” disse Jeffrey H. Miller, distinto professor da microbiologia, a imunologia e genética molecular, e um membro do Instituto da Biologia Molecular do UCLA. “Cada proteína terá sua assinatura auditiva original porque cada proteína tem uma seqüência original. Você pode ouvir a seqüência da proteína.”
“Nós atribuímos uma corda a cada ácido aminado,” disse Rie Takahashi, um assistente de pesquisa do UCLA e um jogador de piano vencedor dum prémio, clàssica treinado. “Nós queremos ver se nós podemos ouvir testes padrões dentro da canção, ao contrário de olhar as letras de uma seqüência do ácido aminado ou da proteína. Nós podemos escutar uma proteína, ao contrário apenas de olhá-la.”
Os blocos de apartamentos de proteínas são seqüências lineares de 20 ácidos aminados diferentes. Atribuir uma nota para cada ácido aminado conduz conseqüentemente a uma escala de 20 notas.
“Uma escala de 20 notas é uma escala demasiado grande,” Takahashi disse. “Você precisa uma escala reduzida, assim que nós emparelhamos ácidos aminados similares junto e usamos cordas e variações da corda para cada ácido aminado. Nós usamos cada componente da canção para indicar uma característica específica da proteína. Nós somos fiéis na conversão da seqüência à canção. O ritmo é ditado pela seqüência da proteína.”
No local dos biólogos (www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/examples.html), você pode escutar as composições e mesmo submeter sua própria seqüência genética e a ter traduzida à canção. O navegador permite que qualquer um envie em uma codificação da seqüência para uma proteína, que então seja convertida na canção e retornada como uma lima do áudio de MIDI. A pesquisa é publicada na Biologia do Genoma, um jornal principal no campo da genómica.
“Eu estava pensando de fazer um projecto como este por anos,” Miller disse, “mas realizou I necessário uma pessoa que tivesse as características originais de ser um geneticista molecular e um músico clássico sério. Quando Eu encontrei Rie, Eu realizei que esta é a pessoa que Eu tenho procurado.”
Takahashi era um universitário do UCLA na microbiologia, na imunologia e na genética molecular que fizeram a pesquisa como uma tese das honras.
“Muitos cientistas gostam da canção clássica,” ela notaram. “Antes Que Eu tomei um curso do Dr. Miller, aqueles dois mundos foram separados na minha mente. Para construir uma ponte sobre os dois é muito rewarding. Meu professor de piano não tem um fundo da ciência, mas quando Eu uso a canção para lhe explicar proteínas, vai do jargão a algo que o interessa realmente.”
Takahashi e Miller não são os primeiros cientistas a tentar converter seqüências da proteína na canção, mas acredita que sua canção é mais melódico e menos “inquieto” do que tentativas precedentes. Inicialmente, Takahashi converteu os ácidos aminados e jogou a canção resultante no piano. Agora estão pilotando um programa informático, escrito pelo colega Frank Pettit, que usa suas regras da tradução para converter as seqüências da proteína à canção. Esperam que este acelerará a tradução de grandes segmentos dos genomas.