Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | हिन्दी | Русский | Svenska | Polski

科学家转换成音乐的蛋白质序列

Published on May 17, 2007 at 9:25 PM · No Comments

加州大学洛杉矶分校的分子生物学家已经变成了古典音乐的原始成分的蛋白质序列。

“我们的音乐转换成蛋白质序列,可以得到一个听觉信号的每一个蛋白质,说:”人Jeffrey H.米勒,微生物学,免疫学和分子遗传学的特聘教授,加州大学洛杉矶分校的分子生物学研究所的成员。 “每一个蛋白质都会有其独特的听觉签名,因为每一个蛋白质具有独特的序列,你可以听到的蛋白质序列。”

“我们分配了一个和弦,每个氨基酸,说:”惠高桥,加州大学洛杉矶分校研究助理,并屡获殊荣,古典训练的钢琴演奏家。 “我们要看到,如果我们能听到在音乐模式,而不是在一个氨基酸或蛋白质序列的字母。,我们可以听的一种蛋白质,而不是仅仅看它。”

蛋白质的组成部分,是20种不同的氨基酸的线性序列。分配一个每个氨基酸的注意,因此,结果在20注意规模。

“一个20注的规模过大的范围内,”高桥说。 “你需要缩小规模,所以我们配对类似的氨基酸,并为每个氨基酸和弦及和弦的变化,我们用音乐来表示一个特定的蛋白质特征的每个组件,我们在转换序列的忠实音乐的节奏所决定的蛋白质序列。“

www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/examples.html )在生物学家的网站,你可以听的成分,甚至提交自己的基因序列和它翻译成音乐。浏览器允许任何人在一个编码一种蛋白质,然后将转换成音乐,作为一个MIDI音频文件返回序列发送。这项研究发表在基因组生物学,在基因组学领域的主要杂志。

“我是做一个像这样多年的项目的思维,”米勒说,“但意识到我需要一个分子遗传学家和严重的古典音乐家的独特特征的人,当我认识了惠,我意识到这是我一直在寻找的人。“

高桥是加州大学洛杉矶分校的本科生在微生物学,免疫学和分子遗传学荣誉论文的研究。

“许多科学家喜欢古典音乐,”她说。 “之​​前我参加了由米勒博士课程,这两个世界在我的脑海分开。为了弥补这两个是非常有益的。我的钢琴老师没有一个科学的背景,但是当我用音乐来向他解释蛋白质,它从胡言乱语的东西,他的真正利益。“

高桥和米勒的首批科学家尝试音乐转换成蛋白质序列,但他们认为他们的音乐旋律和“跳跃”比以前的尝试。起初,高桥转换氨基酸和演奏钢琴音乐。现在他们正在试行一种计算机程序,同事弗兰克佩蒂特,使用其转换规则转换的蛋白质序列音乐写。他们希望这将加快翻译大段的基因组。

高桥首先转换到音乐ThyA的人类蛋白质,这使得胸苷,DNA的重要组成部分。

她还转换亨廷顿的蛋白质,它起着在亨廷顿氏病的主要作用。亨廷顿氏病是三重重复扩展的一个重复的谷氨酰胺序列,使蛋白质失去其应有的功能的疾病,其中的一个例子。这样的扩张导致一种神经紊乱。未经训练的耳朵能听到重复的和弦。

他说:“我们认为这可能是一个巨大的教学工具,儿童,非科学家和视障人士的蛋白质和分子生物学感兴趣,”米勒说。 “当我还是个孩子,我听了”彼得与狼“,这是一个神话般的方式介绍乐器和古典音乐的年轻人。”

在音乐中,个别氨基酸作为和弦表示,类似的氨基酸都是成对。例如,酪氨酸和苯丙氨酸的氨基酸都分配了一个G大调和弦,但它们可以被区别对待,因为在弦的音符是不同的安排。音乐有20注的范围跨越两个八度,但只有13基调。

高桥发表的研究,在加州大学洛杉矶分校的本科学报的早期版本。

作为第二阶段的研究,高桥增加了音乐的变化,并绘制出和弦。

“惠的一些成分声音Chopinesque,”米勒说,令人鼓舞的是她与她的成分,含有的几种蛋白质的变化使一张CD。

http://www.ucla.edu