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科學家轉換蛋白質順序成音樂

Published on May 17, 2007 at 9:25 PM · No Comments

加州大學洛杉磯分校分子生物學家把蛋白質順序變成古典音樂的原始構成。

「我們轉換了蛋白質順序成音樂,并且可以獲得每蛋白質的一個聲音信號」,著名的教授說傑費 H. 米勒,微生物學、免疫學和分子遺傳學和加州大學洛杉磯分校的分子生物學學院的成員。 因為每蛋白質有一個唯一順序, 「每蛋白質將有其唯一聽覺簽名。 您能聽到蛋白質的順序」。

「我們分配了弦到每氨基酸」,一個得獎,古典地被培訓的鋼琴演奏者說 Rie Takahashi、加州大學洛杉磯分校研究助理和。 「我們要發現我們是否能聽到在音樂內的模式,與查看氨基酸或蛋白質順序的信函相對。 我們可以聽蛋白質,與查看它相對」。

蛋白質構件是 20 不同氨基酸線性順序。 因此分配一附註每氨基酸的導致 20 附註縮放比例。

「20 附註縮放比例是太大範圍」, Takahashi 說。 「您需要縮小比例尺,因此我們一起配對相似的氨基酸并且為每氨基酸使用了弦和弦差異。 我們使用音樂的每個要素指示蛋白質的一個特定特性。 我們是忠實的在從這個順序的轉換嚮音樂。 節奏由蛋白質順序指明」。

在生物學家的站點 (www.mimg.ucla.edu/faculty/miller_jh/gene2music/examples.html),您能聽構成和甚而提交您自己的基因順序和安排它被轉換到音樂。 這個瀏覽器在蛋白質的一個順序編碼允許任何人發送,然後將被轉換成音樂并且返回作為密地音頻文件。 這個研究在染色體生物,一個主要日記帳在被發布染色體組的領域。

「我認為執行像這樣的一個項目多年來」,米勒說, 「但是意識到 I 需要有唯一特性的是一位分子遺傳學家和一位嚴重的古典音樂家的人員。 當我會見了 Rie,我意識到這是我正在尋找的人員」。

Takahashi 是執行這個研究作為榮譽稱號論文的微生物學、免疫學和分子遺傳學的加州大學洛杉磯分校大學生。

「許多科學家喜歡古典音樂」,她注意。 「在我採取了從米勒博士前的一條路線,那兩個世界依我所見是單獨的。 要跨接二非常有意義。 我的鋼琴老師沒有科學背景,但是,當我使用音樂解釋蛋白質对他時,它從亂語去確實感興趣他的事」。

Takahashi 和米勒不是嘗試的第一位科學家轉換蛋白質順序成音樂,但是他們相信他們的音樂比早先嘗試更加旋律和 「跳動」。 最初, Takahashi 轉換了氨基酸并且播放在這架鋼琴的發生的音樂。 現在他們駕駛計算機程序,寫由同事弗蘭克 Pettit,使用他們的轉換規律轉換蛋白質順序成音樂。 他們希望這將加速染色體的大細分市場的轉換。

Takahashi 首先轉換了成音樂人力 ThyA 蛋白質,製造胸腺嘧啶脫氧核苷,脫氧核糖核酸一個關鍵部件。

她也轉換了亨廷頓蛋白質,在亨廷頓疾病扮演主角。 亨廷頓疾病是一個被重複的谷氨酰胺順序擴展造成蛋白質丟失其適當的功能三胞胎重複紊亂的示例。 這樣擴展導致一種神經混亂。 一個未經訓練的耳朵能聽到重複的弦。

「我們相信這可以是獲得一個極大的教學工具子項,非科學家和對蛋白質和分子生物學感興趣的視覺障害者」,米勒說。 「當我是孩子,我聽 『彼得和狼』,是一個美妙的方式介紹青年人給樂器和古典音樂」。

在音樂,各自的氨基酸表示作為弦,并且配對相似的氨基酸。 例如,氨基酸酚基乙氨酸和氨基苯基丙酸兩個被分配 G 少校弦,但是他們可以是著名的,因為不同地安排在弦的附註。 音樂有 20 附註範圍跨過二八音度,但是與 13 基本附註。

Takahashi 在加州大學洛杉磯分校大學生科學日記帳上發布了研究的一個初期版本。

作為這個研究的第二個階段, Takahashi 添加了差異到音樂,并且擬訂調和。

「一些 Rie 的構成合理的 Chopinesque」,米勒說,令人鼓舞做與她的構成的一 CD 的她包含幾蛋白質的差異。

http://www.ucla.edu