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Erster Entwurf der Genomsequenz von Aedes aegypti

Published on May 18, 2007 at 11:04 PM · No Comments

Die Entwicklung neuer Strategien zur Prävention und Bekämpfung von Gelbfieber und Dengue-Fieber hat sich zu mehr möglich mit der Fertigstellung des ersten Entwurfs der Genomsequenz von Aedes aegypti von Wissenschaftlern durch Vishvanath Nene at The Institute for Genomic Research (TIGR) und David Severson auf LED der University of Notre Dame.

Das Genom ist die Gesamtheit der genetischen Materials einschließlich der Gene und anderer Teile der DNA in einen Organismus.

Die Forschung erscheint in der 18. Mai 2007 Science Express, in dem Artikel "Genomsequenz von Aedes aegypti, A-Dur Arbovirus Vector." Forscher an 24 Universitäten und anderen Institutionen weltweit dazu beigetragen, den Aufwand.

Zu den Co-Autoren sind Mitglieder der Vector-Borne Infectious Disease Research Group an der Virginia Tech ( www.vectorborne.ibphs.vt.edu ), Zhijian (Jake) Tu, Associate Professor in der Abteilung Biochemie ( www.biochem.vt . edu ); James K Biedler, Biochemie Postdoktorand; Song Li, Forschung Specialist Senior in der Biochemie und Monique Royer Coy, Biochemie Student, und Chunhong Mao, Senior Project Associate mit dem Virginia Bioinformatics Institute an der Virginia Tech.

Tu koordinierte Anstrengungen mit TIGR und fünf Forschungseinrichtungen in den Vereinigten Staaten, Spanien und Frankreich Transposons (TEs) in den Ae kommentieren. aegypti Genoms. TEs sind Segmente von Nukleinsäuren oder genetisches Material, das bewegen des Genoms und haben einen signifikanten Einfluss auf die Struktur und Größe.

Außerdem ist Jinsong Zhu, Assistent Professor für Biochemie an der Virginia Tech, die ein leitender Forscher an der University of California, Riverside, war in diesem Prozess, der bislang etwa 80 Prozent der 15.419 validierten vorhergesagten Protein kodierenden Gene in Ae beteiligt. aegypti. Er erklärt: "Ein wichtiger Teil dieses Projektes ist es Gen-Annotation, welche Zahlen und Standorte der Moskito-Gene in das Genom prognostiziert. Parallel zur Sequenzierung von DNA in den Chromosomen, haben Wissenschaftler auch große Mengen von Boten-RNAs aus verschiedenen Geweben Mücke an unterschiedlichen Entwicklungsstörungen gesammelt sequenziert Stufen. Matching einer Boten-RNA zu einem vorhergesagten Gen validieren Echtheit dieses Gen. "

Die TE-Team von der TU-Labor, entdeckt und beschrieben mehr als 1.000 Transposons, die rund 50 Prozent des gesamten Ae besetzen führen. aegypti Genoms. Zum Beispiel hat eine transposable Element mit dem Namen Feilai mehr als 50.000 Kopien im Genom durchsetzt. Zum Vergleich: Anopheles gambiae, ist die Malaria-Mücke Genom wahrscheinlich weniger als 25 Prozent TEs. Die Ae. aegypti Genom ist fünfmal so groß wie der Malaria-Mücke Genoms.

"Obwohl die Mehrheit der Protein-kodierenden TE Kopien in Ae. Aegypti als entartet erscheinen, eine bedeutende Anzahl von Elementen potenziell aktive TE Kopien haben, was darauf hinweist, dass sie als Werkzeuge für genetische Studien von Mücken entwickelt werden können," Tu sagte.