Het Instituut van de Bio-informatica van Virginia (VBI) bij Technologie van Virginia heeft aangekondigd dat het de grootste ooit studie van Affymetrix GeneChip Microarray voor een installatie experimenteel systeem in het academische onderzoek plaatsen heeft afgerond.
Het 2600 spaanderexperiment onderzoekt het tegen-spel van installatie en ziekteverwekkergenen tijdens besmetting van sojaboon met van wortel-verrotting sojae ziekteverwekkerPhytophthora, met een nadruk op mechanismen van langdurige ziekteweerstand. P. sojae veroorzaakt strenge schade in sojaboongewassen en resulteert jaarlijks in $100-200 miljoen in verliezen voor commerciële landbouwers in de alleen Verenigde Staten.
Veel informatie is verkregen door zorgvuldige studie van enige weerstandsgenen in installaties. Nochtans, heeft deze „laag hangend fruit“ benadering niet in significante langdurige weerstand van gewassen geresulteerd. Plant waarin één enkel gen snel wordt overwonnen door nieuwe spanningen van ziekteverwekkers is gewijzigd. Het experiment GeneChip maakt deel uit van een project op het begrip van en het verbeteren van een meer langdurige vorm van ziekteweerstand geroepen kwantitatieve of multigenic weerstand die wordt gericht.
Adam Jerauld, de Leider van het Team Affymetrix in de Faciliteit van het Laboratorium van de Kern (CLF) merkte op: „Onze faciliteit kon het stadium van de gegevensgeneratie voor dit 2600 spaanderexperiment binnen een periode van zes maanden met succes voltooien. Dit was mogelijke toe te schrijven aan een hoogst efficiënte samenwerking tussen de wetenschappelijk onderzoekers en de capaciteit van ons team aan schaal-op onze mogelijkheden van de serieverwerking. Wij ontvingen ook eersteklas technische steun van Affymetrix.“
Clive Evans, Manager CLF bij VBI, becommentarieerde: „Affymetrix GeneChip® microarrays in de studie wordt gebruikt bestaat uit sondes voor 38 000 sojaboongenen en 15 800 genen dat P.sojae. Wij verhoogden de productiviteit van onze four-fold verwerking Affymetrix om de schaal van dit project aan te passen.“
„VBI is een Nationaal Centrum van de Serie van de Klant met de wetenschappers die van wereldklasse in de installatie en de biomedische wetenschappen werken. Het is een ideale plaats om het grootste Affymetrix landbouw microarray experiment tot op heden door een niet-voor-winstfaciliteit te leiden,“ bovengenoemde Fredrick Pollock, Directeur van Strategische Zaken in Affymetrix. „Wij werkten met de gemeenschap van het sojaboononderzoek om de inhoud voor de Serie van het Genoom van de Sojaboon te ontwikkelen. Affymetrix veroorzaakt momenteel 17 series als deel van zijn Programma van Consortiums GeneChip® en wij zijn opgewekt over het werken met de belangrijke landbouwonderzoekers aan verdere die projecten worden ontworpen om gewassenopbrengsten en de voedingswaarde van het voedsel te verbeteren dat wij.“ hebben gegeten