Das Virginia-Bioinformatik-Institut (VBI) an Virginia-Technologie hat angekündigt, dass sie die größte überhaupt Microarraystudie Affymetrix GeneChip für ein Pflanzenversuchssystem in einer akademischen Forschungseinstellung beendet hat.
Das Experiment mit 2600 Chips erforscht das Antispiel von Pflanzen- und Krankheitserregergenen während der Infektion der Sojabohne mit den Wurzelfäule Krankheitserreger Phytophthora sojae, mit einem Fokus auf Vorrichtungen der langlebigen Krankheitsresistenz. P.-sojae verursacht schweren Schaden in den Sojabohnenernten und Ergebnisse in $100-200 Million jährlich in den Verlusten für Handelslandwirte in den Vereinigten Staaten allein.
Viele Informationen sind durch vorsichtige Studie des einzelnen Resistenzgens in den Pflanzen eingeholt worden. Jedoch hat dieser Anflug „der niedrigen hängenden Frucht“ nicht beträchtlichen langlebigen Widerstand von Ernten ergeben. Pflanzen, in denen ein einzelnes Gen geändert worden ist, werden schnell durch neue Spannungen von Krankheitserregern ausgeglichen. Das GeneChip-Experiment ist ein Teil eines Projekt angestrebten Verständnisses und des Verbesserns eines langlebigeren Formulars der Krankheitsresistenz genannt quantitativer oder multigenic Widerstand.
Adam Jerauld, Affymetrix-Teamleiter im Kern-LaborTeildienst (CLF) erwähnt: „Unser Teildienst war in der Lage, die Datenerzeugungsstufe für dieses Experiment mit 2600 Chips innerhalb eines Sechsmonatszeitraums erfolgreich zu beenden. Dieses lag an einer in hohem Grade effektiven Zusammenarbeit zwischen den Forschungswissenschaftlern und der Fähigkeit unserer Team Schuppe-oben unsere Matrixverarbeitungsfähigkeiten mögliches. Wir empfingen auch erstklassige technische Halterung von Affymetrix.“
Clive Evans, CLF-Manager an VBI, kommentierte: „Die Microarrays Affymetrix GeneChip®, die in der Studie verwendet werden, enthalten Fühler für 38 000 Sojabohnengene und 15 800 P.sojae-Gene. Wir erhöhten die Produktivität unseres Affymetrix Aufbereitens vierfach, um die Schuppe dieses Projektes anzupassen.“
„VBI ist eine Nationale Abnehmer-Reihen-Mitte mit den Weltklassenwissenschaftlern, die in der Pflanze und in den biomedizinischen Wissenschaften arbeiten. Es ist ein idealer Ort zum bis jetzt Leiten das größte Affymetrix-Landwirtschaft Microarrayexperiment durch einen gemeinnützigen Teildienst,“ sagte Fredrick-Pollock, Direktor des Strategischen Geschäfts bei Affymetrix. „Wir arbeiteten mit der Sojabohnenforschungsgemeinschaft, um den Inhalt für die Sojabohnen-Genom-Reihe zu entwickeln. Affymetrix produziert aktuell 17 Reihen als Teil seiner GeneChip®-Konsortien Programm und wir werden über das Arbeiten mit den führenden landwirtschaftlichen Forschern auf den weiteren Projekten erregt, die konstruiert werden, um Ernteerträge und den Nährwert der Nahrung zu verbessern, die wir essen.“