O Instituto da Bioinformática de Virgínia (VBI) na Tecnologia de Virgínia anunciou que terminou nunca o estudo o maior do Microarray de Affymetrix GeneChip para um sistema experimental da planta em um ajuste académico da pesquisa.
A experiência de 2600 microplaquetas explora o contador-jogo de genes da planta e do micróbio patogénico durante a infecção do feijão de soja com os sojae do Phytophthora do micróbio patogénico da raiz-podridão, com um foco em mecanismos da resistência de doença duradouro. Os sojae do P. causam dano severo em colheitas do feijão de soja e resultados em $100-200 milhões anualmente nas perdas para fazendeiros comerciais nos Estados Unidos apenas.
Muita informação foi obtida pelo estudo cuidadoso de únicos genes de resistência nas plantas. Contudo, esta do “aproximação baixo fruto de suspensão” não conduziu à resistência duradouro significativa das colheitas. As Plantas em que um único gene foi alterado são superadas rapidamente por tensões novas dos micróbios patogénicos. A experiência de GeneChip é parte de compreender visada projecto e de melhorar um formulário mais duradouro da resistência de doença chamado resistência quantitativa ou multigenic.
Adam Jerauld, Líder da Equipa de Affymetrix na Facilidade do Laboratório do Núcleo (CLF) observada: “Nossa facilidade podia terminar com sucesso a fase da geração dos dados para esta experiência de 2600 microplaquetas dentro de um semestre. Este era possível devido a uma colaboração altamente eficaz entre os cientistas da pesquisa e a capacidade de nossa escala-acima da equipe nossas capacidades de processamento da disposição. Nós igualmente recebemos o suporte laboral de primeira ordem de Affymetrix.”
Clive Evans, Gerente de CLF em VBI, comentou: “Os microarrays de Affymetrix GeneChip® usados no estudo compreendem pontas de prova para 38 000 genes do feijão de soja e 15 800 genes de P.sojae. Nós aumentamos a produtividade de nosso Affymetrix que processa a quatro-dobra para acomodar a escala deste projecto.”
“VBI é um Centro Nacional da Disposição do Cliente com os cientistas da classe do mundo que trabalham na planta e nas ciências biomedicáveis. É um lugar ideal para conduzir até agora a experiência a maior do microarray da agricultura de Affymetrix por uma facilidade sem fins lucrativos,” disse o Pollock de Fredrick, Director do Negócio Estratégico em Affymetrix. “Nós trabalhamos com a comunidade de pesquisa do feijão de soja para desenvolver o índice para a Disposição do Genoma do Feijão de soja. Affymetrix produz actualmente 17 disposições como parte de seus Consórcios Programa de GeneChip® e nós somos entusiasmado sobre o trabalho com os pesquisadores agrícolas principais em uns projectos mais adicionais projetados melhorar colheitas e o valor nutritivo do alimento que nós comemos.”