最大的 Affymetrix GeneChip 微阵列研究

弗吉尼亚技术的 (VBI)弗吉尼亚分析复杂生物资料的学科学院宣布它完成了工厂实验系统的最大的 Affymetrix GeneChip 微阵列研究在学术研究设置。

2600 筹码实验在大豆的传染时与根腐烂病原生物枯萎病 sojae 的测试工厂和病原生物基因反作用，与在持久抗病力结构的一个重点。 P. sojae 在大豆庄稼每年导致严重故障和结果在 $100-200 百万在商业农夫的损失在单独美国。

信息由唯一阻力基因的仔细研究得到了在工厂中。 然而，此 “低停止的果子”途径未导致庄稼重大的持久阻力。 中一个唯一基因被修改了的工厂在病原生物新菌珠迅速解决。 GeneChip 实验是项目瞄准的了解和改进称定量的抗病力的一份更加持久的表单的一部分或 multigenic 阻力。

亚当 Jerauld， Affymetrix 在陈述的核心实验室设备的 (CLF)小组负责人： “我们的设备能顺利地完成此 2600 筹码实验的数据生成阶段在六个月期间内。 这可能归结于在研究科学家和我们的小组缩放比例的能力的之间高效的协作我们的陈列处理功能。 我们从 Affymetrix 也得到了头等技术支持”。

Clive 伊万斯， VBI 的 CLF 经理，评论了： “用于这个研究的 Affymetrix GeneChip® 微阵列包括 38 000 个大豆基因和 15 800 个 P.sojae 基因的探测。 我们增加生产率我们 Affymetrix 处理四倍适应此项目缩放比例”。

“VBI 是与从事在工厂和生物医学的国际水平的科学家的国家客户列阵中心。 它是迄今做最大的 Affymetrix 农业微阵列试验的一个理想的安排由一个非营利的设备”，狭鳕，有战略意义的商业的主任说 Fredrick 在 Affymetrix 的。 “我们工作以大豆研究团体开发大豆染色体列阵的目录。 Affymetrix 当前引起 17 个列阵作为其 GeneChip® 财团程序一部分，并且我们被激发关于从事与被设计的进一步项目的主导的农业研究员改进谷物收获量和我们吃食物的营养价值”。

Affymetrix 微阵列实验结合二个途径， transcriptional 描出和定量性格所在地 (QTL)映射。 这些途径为解剖介入许多基因的交往的复杂生物学过程是非常合适的。 从此研究得到的信息为了解豆类如何可能保护免受各种各样的病原生物，并且多少个将有价值主机可能防止受到 oomycete 病原生物。 项目小组领导先锋和 VBI Brett Tyler 教授说： “与从在手中现在 CLF 的大量数据集，这个项目的数据分析阶段将开始和预计需要 18 个月”。

VBI 的 CLF 是提供多种高处理量技术和其他科技目前进步水平技术关连的服务的一种多用户资源。 CLF 为 proteomics 的脱氧核糖核酸当前提供分析平台排序和 genotyping，基因表达分析和。

这个项目由从国家科学基金会厂染色体研究方案的合作协议 DBI-0211863 支持。 这个项目是涉及 Saghai Maroof (庄稼和土壤环境科学，弗吉尼亚技术的部门)， Ina Hoeschele (VBI)，安妮 Dorrance (俄亥俄州立大学) 和史蒂夫圣马丁 (俄亥俄州立大学) 的多重学科的协作。

弗吉尼亚技术的 (VBI)弗吉尼亚分析复杂生物资料的学科学院有在了解 “疾病三角”围绕的研究平台主机病原生物环境交往在植物、人和其他动物。 通过成功开辟创新到结合信息技术和生物的跨学科的途径里， VBI 的研究员在生物医学，环境和植物学里解决一些今天关键挑战。

http://www.vt.edu 和 http://www.affymetrix.com