最大的 Affymetrix GeneChip 微陣列研究

弗吉尼亞技術的 (VBI)弗吉尼亞分析複雜生物資料的學科學院宣佈它完成了工廠實驗系統的最大的 Affymetrix GeneChip 微陣列研究在學術研究設置。

2600 籌碼實驗在大豆的傳染時與根腐爛病原生物枯萎病 sojae 的測試工廠和病原生物基因反作用，與在持久抗病力結構的一個重點。 P. sojae 在大豆莊稼每年導致嚴重故障和結果在 $100-200 百萬在商業農夫的損失在單獨美國。

信息由唯一阻力基因的仔細研究得到了在工廠中。 然而，此 「低停止的果子」途徑未導致莊稼重大的持久阻力。 中一個唯一基因被修改了的工廠在病原生物新菌珠迅速解決。 GeneChip 實驗是項目瞄準的瞭解和改進稱定量的抗病力的一份更加持久的表單的一部分或 multigenic 阻力。

亞當 Jerauld， Affymetrix 在陳述的核心實驗室設備的 (CLF)小組負責人： 「我們的設備能順利地完成此 2600 籌碼實驗的數據生成階段在六個月期間內。 這可能歸結於在研究科學家和我們的小組縮放比例的能力的之間高效的協作我們的陳列處理功能。 我們從 Affymetrix 也得到了頭等技術支持」。

Clive 伊萬斯， VBI 的 CLF 經理，評論了： 「用於這個研究的 Affymetrix GeneChip® 微陣列包括 38 000 個大豆基因和 15 800 個 P.sojae 基因的探測。 我們增加生產率我們 Affymetrix 處理四倍適應此項目縮放比例」。

「VBI 是與從事在工廠和生物醫學的國際水平的科學家的國家客戶列陣中心。 它是迄今做最大的 Affymetrix 農業微陣列試驗的一個理想的安排由一個非營利的設備」，狹鱈，有戰略意義的商業的主任說 Fredrick 在 Affymetrix 的。 「我們工作以大豆研究團體開發大豆染色體列陣的目錄。 Affymetrix 當前引起 17 個列陣作為其 GeneChip® 財團程序一部分，并且我們被激發關於從事與被設計的進一步項目的主導的農業研究員改進穀物收穫量和我們吃食物的營養價值」。

Affymetrix 微陣列實驗結合二個途徑， transcriptional 描出和定量性格所在地 (QTL)映射。 這些途徑為解剖介入許多基因的交往的複雜生物學過程是非常合適的。 從此研究得到的信息為瞭解豆類如何可能保護免受各種各樣的病原生物，并且多少個將有價值主機可能防止受到 oomycete 病原生物。 項目小組領導先鋒和 VBI Brett Tyler 教授說： 「與從在手中現在 CLF 的大量數據集，這個項目的數據分析階段將開始和預計需要 18 個月」。

VBI 的 CLF 是提供多種高處理量技術和其他科技目前進步水平技術關連的服務的一種多用戶資源。 CLF 為 proteomics 的脫氧核糖核酸當前提供分析平臺排序和 genotyping，基因表達分析和。

這個項目由從國家科學基金會廠染色體研究方案的合作協議 DBI-0211863 支持。 這個項目是涉及 Saghai Maroof (莊稼和土壤環境科學，弗吉尼亞技術的部門)， Ina Hoeschele (VBI)，安妮 Dorrance (俄亥俄州立大學) 和史蒂夫聖馬丁 (俄亥俄州立大學) 的多重學科的協作。

弗吉尼亞技術的 (VBI)弗吉尼亞分析複雜生物資料的學科學院有在瞭解 「疾病三角」圍繞的研究平臺主機病原生物環境交往在植物、人和其他動物。 通過成功開闢創新到結合信息技術和生物的跨學科的途徑裡， VBI 的研究員在生物醫學，環境和植物學裡解決一些今天關鍵挑戰。

http://www.vt.edu 和 http://www.affymetrix.com