अत्याधुनिक bioinformatics सॉफ़्टवेयर प्रोग्राम्स

इस तरह मानव जीनोम परियोजना के रूप में बड़े पैमाने पर उपक्रमों डेटा का भारी मात्रा में उत्पादन किया है।

सभी यह समझ बनाने के लिए, शक्तिशाली गणितीय और सांख्यिकीय एल्गोरिदम, अंतःविषय क्षेत्र bioinformatics बुलाया में जिसके परिणामस्वरूप विकसित किए गए." जीनोम अनुक्रम डेटा के साथ silico उपकरणों की जांच के द्वारा, जीव सकते हैं कार्यों विशिष्ट जीन का अनुमान, प्रजातियों के बीच विकासवादी relatedness का मूल्यांकन करें और डीएनए वेरिएंट कि रोग के भविष्य कहनेवाला रहे हैं की पहचान। इस बहुमूल्य जानकारी कर सकते हैं दोनों के पूरक हैं और अधिक परंपरागत प्रयोगशाला आधारित प्रायोगिक अध्ययन ड्राइव है। इस महीने रिलीज सर्दी वसंत बंदरगाह प्रोटोकॉल के दो लेख है कि सिद्धांतों और अनुप्रयोगों के अत्याधुनिक bioinformatics सॉफ्टवेयर प्रोग्राम के बारे में बात पर प्रकाश डाला गया; दोनों स्वतंत्र रूप से उपलब्ध ऑनलाइन (www.cshprotocols.org) कर रहे हैं।

पहली बार स्वतंत्र रूप से उपलब्ध लेख ( http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/14/pdb.top17) कैसे विस्फोट (बुनियादी स्थानीय संरेखण खोज उपकरण) प्रोग्राम का उपयोग करने पर मार्गदर्शन प्रदान करता है। विस्फोट कि सबसे अधिक बड़े डेटाबेस समानताएं के साथ डीएनए और प्रोटीन दृश्यों के लिए खोज करने के लिए प्रयोग किया जाता है के लिए उपकरण है। लेख, विस्फोट, के लिए एक उपयोगकर्ता के गाइड का उद्देश्य उसके एल्गोरिथम आधार का एक सामान्य अवलोकन के रूप में अच्छी तरह से विभिन्न ब्लास्ट कार्यक्रम और उनके उपयुक्त आवेदनों का विवरण भी शामिल है। यह बेहतर समझ और विस्फोट करने के लिए अपने सिस्टम पर लागू करने की मांग जीव की एक विस्तृत श्रृंखला के लिए उपयोगी हो जाएगा।

दूसरा स्वतंत्र रूप से उपलब्ध लेख वर्णन करता है कि एक कम्प्यूटेशनल पाइप लाइन कि डीएनए वेरिएंट SNPs (सिंगल-nucleotide polymorphisms) से अनाज में अनुक्रम डेटा कहा जाता है की पहचान करने के लिए ऑप्टिमाइज़ किया गया है। दृश्यों, 454 जीव विज्ञान, से अत्याधुनिक तकनीक के साथ उत्पन्न गठबंधन किया और मकई जीनोम विस्फोट और cross_match (एक और कम्प्यूटेशनल उपकरण) का उपयोग करने के लिए anchored रहे हैं। फिर, एक तीसरा PolyBayes नामक कार्यक्रम गठबंधन दृश्यों में SNPs के लिए खोज करने के लिए प्रयोग किया जाता है। इस द्वारा कटाव GOST-डिस्कवरी पाइप लाइन का वर्णन लेख http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/14/pdb.prot4786पर उपलब्ध है।

http://www.cshl.org