In plaats van onveranderlijke merkgebonden software, om het even welke species, lijkt de genetische informatie op open broncode die constant en wordt geknepen geoptimaliseerd om aan de gebruiker-specifieke behoeften te voldoen.
Maar wat de delen van de code hebben weerstaan is de test van tijd en die de delen snelle evolutieve verandering hebben ondergaan moeilijk geweest te beoordelen.
Een internationale samenwerking door onderzoekers in het Instituut Salk voor Biologische Studies, de Universiteit van Chicago, en het Max Planck Instituut voor OntwikkelingsBiologie ontwikkelde een eenvoudige methode om gehele genomen voor alle die softwaremoeilijke situaties en veiligheidsflarden te kammen in tijd worden geaccumuleerd. In een eerste proeflooppas, catalogiseerden de wetenschappers de genetische variaties in 23 spanningen van thaliana van Arabidopsis van het mosterdonkruid die uit de wildernis helemaal over de wereld werden bijeengezocht.
„Onze studie vertegenwoordigt één van het eerste gehele genoomaftasten voor niveaus en de patronen van genetische variatie binnen species,“ zegt Joseph R. Ecker, Ph.D., professor in het Laboratorium van de Biologie van de Installatie en directeur van het Laboratorium van de Analyse van Genomic van het Instituut Salk, die de huidige die studie leidden in de online uitgave van vorige week van de Werkzaamheden van de Nationale Academie van Wetenschap wordt gepubliceerd. „Het openbaart de gebieden die momenteel door natuurlijke selectie worden gericht of tijdens het evolutieve verleden.“ zo geweest
In een onafhankelijke studie de medewerkers -- dit die keer door Detlef Weigel, Ph.D., directeur van het Max Planck Institute voor OntwikkelingsBiologie in Tübingen, Duitsland, en een toevoegselprofessor bij het Instituut Salk wordt geleid -- ging door de genomen van 20 verschillende spanningen die van thaliana Arabidopsis met een gelijke fijn-getande kam, hen toestaan om de nauwkeurige aard van de veranderingen te bepalen. De bevindingen van de tweede studie worden gepubliceerd in 20 Juli uitgave van de dagboekWetenschap.
„Wij vonden dat één van de 10 genen zeer verschillend is,“ zeggen Weigel. „Deze plasticiteit is echt verrassend voor een genoom dat zeer gestroomlijnd is en in tegenstelling tot grotere genomen heel wat troepDNA niet bevat,“ hij toevoegt.
Een decennium geleden, werd Arabidopsis wijd goedgekeurd door installatiewetenschappers als gemakkelijk gemanipuleerd model voor andere installaties omdat het eenvoudig om in het laboratorium is te groeien, een korte het levenscyclus en een klein genoom heeft. Vergeleken bij graan, dat wel zou kunnen hebben 2.5 miljard basisparen van DNA en het menselijke genoom met ruwweg 3 miljard paren, heeft Arabidopsis ongeveer 120 slechts miljoen basisparen van DNA.
Met nergens om te lopen, zijn de installaties onder constante bedreiging van hitte, koud, hoog zuurheid of zoutgehalte, of ziekteverwekkers zoals virussen en blad-smakkende insecten. In reactie, mobiliseren de installaties fysiologische en biochemische defensie die hen helpt overleven. „Wij verwachtten dat bepaalde klassen van genen zijn hoogst veranderlijke toe te schrijven aan natuurlijke selectie in verschillende milieu's. Beide studies openbaarden welke leden van de genfamilie inderdaad door evolutie werden gevormd,“ zegt precies Justin Borevitz, Ph.D., een vroegere post-doctorale onderzoeker in het laboratorium Ecker en nu een hulpprofessor in de Afdeling van Ecologie en Evolutie bij de Universiteit van Chicago.