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ゲノムをとかす簡単な方法

Published on July 20, 2007 at 11:52 AM · No Comments

不変の所有権を主張できるソフトウエアの代りに、どの種でも、遺伝情報ユーザーの細目の必要性を満たすために絶えず微調整され、最適化される開いた原始コードに類似しています。

しかしコードの部分が抗した部品が経、時間のテストは急速な発展の変更査定しにくいの。

生物的調査のための Salk の協会、シカゴ大学、および進化の生物学のための最大Planck 協会の研究者による国際協力は一定時間にわたり集まったすべてのソフトウェアの苦境および機密保護パッチのための全ゲノムをとかすために簡単な方法を開発しました。 最初の試運転では、科学者は野生から世界中集められたマスタードの雑草の Arabidopsis の thaliana の 23 の緊張の遺伝の変化をカタログしました。

「私達の調査種内の遺伝の変化のレベルそしてパターンのための最初の全ゲノムスキャンの 1 つを表します」、は国家科学院の進行の先週のオンライン版で出版された現在の調査を導いた Salk の協会の Genomic 分析の実験室のプラント生物学実験室のヨセフ R. を言います Ecker、 Ph.D。、教授およびディレクター。 「それは自然淘汰によって目標とされるか、または発展の過去の間に」。そう現在あってしまった領域を明らかにします

独立した調査共作者 -- 今回はテュービンゲン、ドイツおよび Salk の協会で付加物教授の進化の生物学のための Planck の最大協会のデトレフ Weigel、 Ph.D。、ディレクターによって導きました -- 良歯付き櫛との Arabidopsis の thaliana の 20 の緊張のゲノムを通って行きま、変更の厳密な性質を定めるようにそれらがします。 第 2 調査の調査結果はジャーナル科学の 7 月 20 日問題で出版されます。

「私達は 10 の遺伝子からのが非常に異なっていることが」、言います Weigel を分りました。 「この可塑性非常に合理化されて、同じでなくより大きいゲノムが多くのがらくた DNA を含んでいないゲノムのために偽りなく意外」、は彼追加しますです。

ディケイド前に、 Arabidopsis は他のプラントのための容易に処理されたモデルとしてプラント科学者によって広くそれが実験室で育ちやすいので持っています短い寿命のサイクルおよび小さいゲノムを採用されました。 大体 30億ペアの DNA そしてヒトゲノムの 25億基礎ペア程に多数があるかもしれないトウモロコシと比較されて、 Arabidopsis に DNA の約 120,000,000 の基礎ペアがありますただ。

動作するべきどことも分からぬ所によってプラントはウイルスのような熱からの一定した脅威の下に、風邪、高い酸味または塩分、または病原体および葉食べる昆虫あります。 それに答えて、プラントはそれらが存続するのを助ける生理学的で、生化学的な防衛を動員します。 「私達は異なった環境の自然淘汰が極めて変わりやすい原因であると遺伝子のある特定のクラスが期待しました。 遺伝子の家族が改革によって全く形づいた調査は両方ともシカゴ大学で正確に」、言います Ecker の実験室のジャスティン Borevitz、 Ph.D。、前のポストドクターおよび生態学および改革の部門の今助教授を明らかにしました。