梳染色体的简单的方法

而不是不变的专用软件，任何种类，基因信息类似于经常被调整并且被优选适应用户特定需要的开放来源代码。

但是，并且这个编码的部分承受了的零件经过迅速演变更改是难估计时间的测试。

由研究员的一次国际合作生物研究 Salk 学院，芝加哥大学和发展生物最大Planck 学院的开发一个简单的方法梳随着时间的推移被累计的所有软件解决和证券补丁程序的全部的染色体。 在第一次试航，科学家编目了在从通配收集全世界芥末杂草 Arabidopsis thaliana 的 23 张力的上基因变化。

“我们的研究表示其中一基因差异的级别和模式的第一全部的染色体扫描在种类内的”，在 Salk 学院基因组分析实验室的工厂生物实验室和主任说约瑟夫 R. Ecker、 Ph.D。，教授，导致在国家科学院行动上星期的在线编辑发布的这个当前研究。 “它显示当前由自然选择瞄准或如此是在演变过去期间的地区”。

在一个独立研究中合作者 -- 这次由德特勒夫 Weigel、最大 Planck 学院的 Ph.D。，院长发展生物导致在蒂宾根、德国和附属教授在 Salk 学院 -- 审阅 Arabidopsis thaliana 20 不同张力染色体与一把甚而细致齿状的梳子的，给他们确定更改的确切的本质。 第二个研究的发现在日记帐科学的 7月 20日问题被发布。

“我们发现一个出于 10 个基因是非常不同的”，说 Weigel。 “此可塑性正确地惊奇对是非常效率化的，并且不同的更大的染色体不包含很多旧货脱氧核糖核酸的染色体”，他添加。

十年前， Arabidopsis 由植物科学家广泛采用作为其他工厂的一个容易地被操作的设计，因为是简单的在实验室里增长，有一个短寿命循环和一条小的染色体。 与玉米比较，也许有多达 25亿基本对脱氧核糖核酸和人类基因组与大致 30亿对， Arabidopsis 只有大约 120 百万个基本对脱氧核糖核酸。

运行的无处，工厂在自热的恒定的威胁外、感冒、高酸度或者盐分或者病原生物例如病毒和叶子用力嚼昆虫。 合情合理工厂动员帮助他们生存的生理和生物化学的辩护。 “我们盼望基因某些选件类很易变归结于自然选择用不同的环境。 基因家庭成员的确塑造由演变的两个研究在 Ecker 实验室显示了”，精密地说贾斯廷 Borevitz、 Ph.D。，前博士后和现在一位助理教授生态和演变的部门的在芝加哥大学。

通常，不随着时间的推移更改的基因在严格的负选择下，因为他们执行重要管理功能，而广泛变化例如抗病力基因的基因在严格的正选择下。 “我们报道了这个光谱的两个结尾并且最终了获得一个顶部列表没有更改，并且很多更改一个顶部列表”，解释 Borevitz。 “所有数据在一个公共可访问的数据库安置了，并且到处研究员能现在查寻他们偏爱的基因”。

要装配他们的列表， Ecker 小组倾吐在从古板的基因筹码技术派生的数据，用 Arabidopsis 细胞表示的每个基因 25 个核苷酸长的范例被察觉在是公认的微阵列一个微小的载玻片上。 被砍不同的张力的染色体然后允许束缚对他们的被固定的副本。 减少的杂交导致告诉的信号研究员哪些地区染色体与充分地排序的参考张力不同于。

“此方法是简单和比较便宜的，并且可以适用于全部的染色体排序，并且为的所有有机体哪些基因列阵是可用的或可以容易地做”，解释 Ecker。 “因此它对实践演变染色体组的广泛的观众有吸引力”。

Weigel 的小组进一步去步骤和在包括在脱氧核糖核酸两条子线的每个可能的核苷酸替换的 5 个大列阵在接近十亿个 25-mers 帮助下再有效排序全部的染色体铺磁砖的。 高分辨率途径显示了特定变化的高数量在属于所谓的 F 配件箱总科的基因上的，成员起在标记的蛋白质的关键的作用降低的。

“如显示由两个研究，港口专业作用在通配人口更改的许多基因可能斡旋与这个环境的交往”， Weigel 说。 “根本地，在更加自然的情况下将要求实验详尽地珍重这样顺序差异功能相关性”。

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