梳染色體的簡單的方法

而不是不變的專用軟件，任何種類，基因信息類似於經常被調整并且被優選適應用戶特定需要的開放來源代碼。

但是，并且這個編碼的部分承受了的零件經過迅速演變更改是難估計時間的測試。

由研究員的一次國際合作生物研究 Salk 學院，芝加哥大學和發展生物最大Planck 學院的開發一個簡單的方法梳隨著時間的推移被累計的所有軟件解決和證券補丁程序的全部的染色體。 在第一次試航，科學家編目了在從通配收集全世界芥末雜草 Arabidopsis thaliana 的 23 張力的上基因變化。

「我們的研究表示其中一基因差異的級別和模式的第一全部的染色體掃描在種類內的」，在 Salk 學院基因組分析實驗室的工廠生物實驗室和主任說約瑟夫 R. Ecker、 Ph.D。，教授，導致在國家科學院行動上星期的在線編輯發布的這個當前研究。 「它顯示當前由自然選擇瞄準或如此是在演變過去期間的地區」。

在一個獨立研究中合作者 -- 這次由德特勒夫 Weigel、最大 Planck 學院的 Ph.D。，院長發展生物導致在蒂賓根、德國和附屬教授在 Salk 學院 -- 審閱 Arabidopsis thaliana 20 不同張力染色體與一把甚而細致齒狀的梳子的，給他們確定更改的確切的本質。 第二個研究的發現在日記帳科學的 7月 20日問題被發布。

「我們發現一個出於 10 個基因是非常不同的」，說 Weigel。 「此可塑性正確地驚奇對是非常效率化的，并且不同的更大的染色體不包含很多舊貨脫氧核糖核酸的染色體」，他添加。

十年前， Arabidopsis 由植物科學家廣泛採用作為其他工廠的一個容易地被操作的設計，因為是簡單的在實驗室裡增長，有一個短壽命循環和一條小的染色體。 與玉米比較，也許有多達 25億基本對脫氧核糖核酸和人類基因組與大致 30億對， Arabidopsis 只有大約 120 百萬個基本對脫氧核糖核酸。

運行的無處，工廠在自熱的恆定的威脅外、感冒、高酸度或者鹽分或者病原生物例如病毒和葉子用力嚼昆蟲。 合情合理工廠動員幫助他們生存的生理和生物化學的辯護。 「我們盼望基因某些選件類很易變歸結於自然選擇用不同的環境。 基因家庭成員的確塑造由演變的兩個研究在 Ecker 實驗室顯示了」，精密地說賈斯廷 Borevitz、 Ph.D。，前博士後和現在一位助理教授生態和演變的部門的在芝加哥大學。

通常，不隨著時間的推移更改的基因在嚴格的負選擇下，因為他們執行重要管理功能，而廣泛變化例如抗病力基因的基因在嚴格的正選擇下。 「我們報道了這個光譜的兩個結尾并且最終了獲得一個頂部列表沒有更改，并且很多更改一個頂部列表」，解釋 Borevitz。 「所有數據在一個公共可訪問的數據庫安置了，并且到處研究員能現在查尋他們偏愛的基因」。

要裝配他們的列表， Ecker 小組傾吐在從古板的基因籌碼技術派生的數據，用 Arabidopsis 細胞表示的每個基因 25 個核苷酸長的範例被察覺在是公認的微陣列一個微小的載玻片上。 被砍不同的張力的染色體然後允許束縛对他們的被固定的副本。 減少的雜交導致告訴的信號研究員哪些地區染色體與充分地排序的參考張力不同於。

「此方法是簡單和比較便宜的，并且可以適用於全部的染色體排序，并且為的所有有機體哪些基因列陣是可用的或可以容易地做」，解釋 Ecker。 「因此它對實踐演變染色體組的廣泛的觀眾有吸引力」。

Weigel 的小組進一步去步驟和在包括在脫氧核糖核酸兩條子線的每個可能的核苷酸替換的 5 個大列陣在接近十億个 25-mers 幫助下再有效排序全部的染色體鋪磁磚的。 高分辨率途徑顯示了特定變化的高數量在屬於所謂的 F 配件箱總科的基因上的，成員起在標記的蛋白質的關鍵的作用降低的。

「如顯示由兩個研究，港口專業作用在通配人口更改的許多基因可能斡旋與這個環境的交往」， Weigel 說。 「根本地，在更加自然的情況下將要求實驗詳盡地珍重這樣順序差異功能相關性」。

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