De patiënten van Kanker hebben geen tijd te verspillen. Velen gaan door verscheidene verschillende behandelingen, echter, vinden die efficiënter is tegen hun bijzonder type van tumor.
Aldus, zou een algoritme dat kon snel helpen moleculaire informatie over de bijzondere tumor van een patiënt sorteren en kon helpen deze informatie aan de juiste drugbehandeling aanpassen een doorbraak van enorme waarde zijn. Dan Theodorescu, M.D., Ph.D., een Universiteit van de oncoloog van Virginia en kankerbioloog, en Jae Lee, Ph.D., een computerbioloog en een bio-informaticastatisticus, heeft enkel zulk een systeem de weg bereid. Dit werk impliceerde samenwerking met collega's bij het Nationale Instituut van Kanker, Inc. GeneLogic en de Universiteit van de Afdeling van de Wetenschappen van de Computer van Virginia. Zij publiceerden hun resultaten de week van 23 Juli in de Vroege Uitgave van Proceeedings van de Nationale Academie van Wetenschappen, gevonden online.
Gebruikend een paneel van 60 diverse, menselijke kankercellenvariëteiten van het Nationale Instituut van Kanker (NCI-60) die, bedachten de onderzoekers en testten een algoritme wordt ontworpen om de beste potentiële behandeling voor een bepaalde tumor in een bepaalde patiënt aan te passen.
Eerder, werden de NCI-60 cellenvariëteiten gebruikt aan het scherm meer dan 100.000 chemische samenstellingen voor hun activiteit tegen kanker. Deze drugreacties, echter, werden niet absoluut verbonden met klinische doeltreffendheid in patiënten. Een Andere kwestie is dat de 60 cellenvariëteiten de kankertypes omvatten geen van het grootste belang (bijvoorbeeld, waren bepaalde blaaskanker, lymphomas, en kleine cellongkankers niet onder de 60 bestudeerde lijnen).
De onderzoekers onderzochten of de gegevens van de druggevoeligheid van de 60 kankercellenvariëteiten in nuttige informatie zouden kunnen worden geëxtrapoleerd over andere tumors of kankercellenvariëteiten. In feite, vonden zij dat hun, het systeem van de coexpressionextrapolatie (COXEN), zou kunnen worden gebruikt om druggevoeligheid voor de cellenvariëteiten van blaaskanker aan twee gemeenschappelijke chemotherapie nauwkeurig te voorspellen, cisplatin en paclitaxel.
„Alhoewel deze de celreeks van NCI geen diepgaande encyclopedie van kankercellen was, vonden wij wij de beschikbare gegevens konden gebruiken om gevolgtrekkingen over andere celtypes te maken wij onderzochten. Het algoritme is een steen Rosetta voor het vertalen van de NCI-Bestudeerde drugs aan een andere cellenvariëteit of de menselijke tumor,“ zegt Dr. Theodorescu, directeur van UVa Paul Mellon Prostate Cancer Institute en hogere auteur van de studie. „Wij geloven wij een efficiënte manier hebben gevonden om kankertherapie te personaliseren.“ Het UVa onderzoeksteam kon de klinische reacties van de patiënten van borstkanker met behandeld met algemeen gebruikte chemotherapie voorspellen, docetaxel en tamoxifen.