Krebspatienten haben nicht die Zeit zu vergeuden. Viele laufen einige verschiedene Behandlungen jedoch durch ein zu finden, das gegen ihr bestimmtes Baumuster des Tumors effektiver ist.
So würde ein Algorithmus, der schnell, helfen könnte molekulare Informationen über den bestimmten Tumor eines Patienten zu sortieren und helfen, könnte diese Informationen an die rechte medizinische Behandlung anzupassen, ein Durchbruch des enormen Wertes sein. Dan Theodorescu, M.D., Ph.D., eine Universität von Virginia-Onkologen und Krebsbiologe und Jae Lee, Ph.D., ein Computerbiologe und Bioinformatikstatistiker, haben gerade mit solch einer Anlage vorangegangen. Diese Arbeit bezog Zusammenarbeit in Kollegen am Nationalen Krebsinstitut, an GeneLogic Inc. und an der Universität der Virginia-Informatik-Abteilung mit ein. Sie veröffentlichten ihre Ergebnisse die Woche Vom 23. Juli herein der Frühen Ausgabe des Proceeedings der National Academy Of Sciences, Fanden online.
Unter Verwendung eines Panels von 60 verschieden, planten menschliche Krebszelllinien vom Nationalen Krebsinstitut (NCI-60), die Forscher und prüften einen Algorithmus, der konstruiert wurde, um die besten möglichen Behandlungen für einen bestimmten Tumor bei einem bestimmten Patienten übereinzustimmen.
Vorher wurden die Zellformen NCI-60 verwendet, um mehr als 100.000 chemische Verbindungen für ihre krebsbekämpfende Aktivität mit filter zu versehen. Diese mischen Antworten Drogen bei, jedoch wurden nicht bestimmt mit klinischer Wirksamkeit bei Patienten verbunden. Anderes Thema ist, dass die 60 Zellformen nicht höchst wichtige Krebsbaumuster umfaßten (zum Beispiel, war- bestimmte Blasenkrebse, Lymphome und kleiner Zelllungenkrebs nicht unter den 60 studierten Zeilen).
Die Forscher nachgeforscht, ob die Drogenempfindlichkeitsdaten der 60 Krebszelllinien in nützliche Informationen über andere Tumoren oder Krebszelllinien extrapoliert werden konnten. Tatsächlich fanden sie, dass ihr, Anlage coexpression Extrapolation (COXEN), verwendet werden könnte, um Drogenempfindlichkeit für Blasenkrebszelllinien zu zwei geläufigen Chemotherapien, zu cisplatin und zu paclitaxel genau vorauszusagen.
„Selbst wenn dieses NGI-Zellset keine vollständige Enzyklopädie von Krebszellen war-, fanden wir, dass wir die erhältlichen Daten verwenden könnten, um Schlussfolgerungen über andere Zellbaumuster zu zeichnen, die wir erforschten. Der Algorithmus ist ein Rosetta-Stein für das Übertragen von den NGI-studierten Drogen zu jeder möglicher anderen Zellform, oder menschlicher Tumor,“ sagt Dr. Theodorescu, Direktor des ProstataKrebs-Instituts UVa Paul Mellon und des älteren Autors der Studie. „Wir glauben, dass wir eine effektive Art gefunden haben, Krebstherapie zu personifizieren.“ Das UVa-Forschungsteam war in der Lage, die klinischen Antworten von Brustkrebspatienten mit behandelt mit allgemein verwendeten Chemotherapien, docetaxel und Tamoxifen vorauszusagen.