I Malati di cancro non hanno tempo da sprecare. Molti passano con i vari trattamenti, tuttavia, trovare uno che è più efficace contro il loro tipo particolare di tumore.
Quindi, un algoritmo che potrebbe contribuire rapido ad ordinare le informazioni molecolari sul tumore particolare di un paziente e potrebbe contribuire a abbinare questi informazioni al giusto trattamento della droga sarebbe un'innovazione del valore enorme. Dan Theodorescu, M.D., Ph.D., un'Università di oncologo della Virginia e di biologo del cancro e Jae Lee, Ph.D., un biologo di calcolo e statistico di bioinformatica, ha aperto la strada appena ad un tal sistema. Questo lavoro ha compreso la collaborazione con i colleghi all'Istituto Nazionale contro il Cancro, a GeneLogic Inc. ed all'Università di Instituto dell'Informatica Della Virginia. Ha pubblicato i loro risultati la settimana Del 23 luglio nella Prima Edizione del Proceeedings dell'Accademia Nazionale delle Scienze, ha trovato online.
Facendo Uso di un comitato di 60 diversi, le linee cellulari umane del cancro dall'Istituto Nazionale contro il Cancro (NCI-60), i ricercatori hanno inventato e verificato un algoritmo destinato per abbinare i migliori trattamenti potenziali per un tumore particolare in un paziente particolare.
Precedentemente, le linee cellulari NCI-60 sono state usate per schermare più di 100.000 composti chimici per la loro attività anticancro. Questi drogano le risposte, tuttavia, definitivamente non sono stati collegati all'efficacia clinica in pazienti. L'Un'altra questione è che le 60 linee cellulari non hanno compreso i tipi importanti del cancro (per esempio, determinati cancri di vescica, i linfomi ed i piccoli cancri polmonari delle cellule non erano fra le 60 righe studiate).
I ricercatori esaminatori se i dati della sensibilità della droga delle 60 linee cellulari del cancro potrebbero essere estrapolati in informazioni utili su altri tumori o linee cellulari del cancro. Infatti, hanno trovato che loro, il sistema dell'estrapolazione di coexpression (COXEN), potrebbe essere usato per predire esattamente la sensibilità della droga per le linee cellulari del cancro di vescica alle due chemioterapie, cisplatin e paclitaxel comuni.
“Anche se questo insieme delle cellule di NSC non era un'enciclopedia esauriente delle cellule tumorali, abbiamo trovato che potremmo usare i dati disponibili per trarre le conclusioni circa altri tipi delle cellule stavamo esplorando. L'algoritmo è una Stele di Rosetta per la traduzione dalle droghe NSC-studiate a qualunque altra linea cellulare o tumore umano,„ dice il Dott. Theodorescu, Direttore dell'Istituto del Carcinoma della Prostata di UVa Paul che Mellon e dell'autore senior dello studio. “Crediamo che abbiamo trovato un modo efficace di personalizzare la terapia del cancro.„ Il gruppo di ricerca di UVa poteva predire le risposte cliniche dei pazienti di cancro al seno con trattato con le chemioterapie, il docetaxel ed il tamoxifene comunemente usati.