新しいアルゴリズムは最良の抗癌性の処置に腫瘍のセルに一致させます

癌患者は無駄になる時間がありません。 しかし多数は複数の異なった処置によって腫瘍の特定の種類に対してより有効である 1 つを見つけることを行きます。

従って、患者の特定の腫瘍についての分子情報のソートを急速に助け、右の薬剤の処置にこの情報の一致を助けることができるアルゴリズムは巨大な値の進歩です。 ヴァージニアの腫瘍学者のダン Theodorescu、 M.D.、 Ph.D。、大学はおよび癌の生物学者および Jae リー、 Ph.D。、計算の生物学者および生物情報学の統計学者、ちょうどそのようなシステムを開拓しました。 この作業は国立癌研究所、 GeneLogic Inc. およびヴァージニアのコンピュータサイエンス学部の大学で同僚と共同を含みました。 それらは週結果を国家科学院の Proceeedings の早い版の 7 月 23 日の、オンラインで見つけました出版しました。

多様な 60 のパネルを使用して国立癌研究所 (NCI-60) からの人間の癌細胞ラインは、研究者特定の患者の特定の腫瘍のための最もよく潜在的な処置に一致させるように設計されているアルゴリズムを案出し、テストしました。

以前は、 NCI-60 セルラインが抗癌性の作業のための 100,000 以上の化合物を選別するのに使用されました。 これらは応答に薬剤を入れます、しかし、確定的に患者の臨床有効性にリンクされませんでした。 別の問題は 60 のセルラインがあらゆる面で重要な癌のタイプを含まなかったことです (例えば、ある特定の膀胱癌、リンパ腫および小さいセル肺癌は調査された 60 ライン間にありませんでした)。

60 の癌細胞ラインの薬剤の感度データが他の腫瘍または癌細胞ラインの有益な情報に外挿法で推定することができるかどうか調査される研究者。 実際は、彼らは彼等の、正確に 2 つの共通の化学療法、 cisplatin および paclitaxel に膀胱癌のセルラインのための薬剤の感度を予測するのに coexpression の外挿 (COXEN) システムが、使用できることが分りました。

「この NCI のセルセットが癌細胞の徹底的な百科事典ではなかったのに、私達は私達が探索していた他のセルタイプについての結論を出すのに私達が使用できるデータを使用できることを見つけました。 アルゴリズムは NCI 調査された薬剤へも変換のためのロゼッタ石からの他のどのセルラインですまたは人間の腫瘍」、先生を調査の UVa ポールメロンの前立腺癌の協会そして年長の著者のディレクター言います Theodorescu。 「私達は私達が癌療法を個人化する効果的な方法を」。見つけたことを信じます UVa の調査チームは広く使われた化学療法、 docetaxel および tamoxifen と扱われるの乳癌患者の臨床応答を予測できました。

この研究の最もエキサイティングな面は療法への忍耐強い応答の予測に加えてそれ、 COXEN のアルゴリズム使用することができます癌のあらゆる形式の有効な混合物を検出するのにです。 分子レベルで両方癌細胞および薬剤の作業を検査するアルゴリズムの性質によって、これらの最近検出された薬剤は患者で有効なべきです。 COXEN を使用して有効性のためのこの前スクリーニングは新しい混合物をテストする臨床試験の故障率を非常に下げるべきです。 同様に、薬剤の発見の時が研究所で減るので、薬剤の費用はまた来ます。 基本的にはそれは薬剤に時間を節約するクリニックに近い方の多くをしている化学者を連れて来ます。

たくさんの抗癌性の作業のための化学的に定義された混合物そして自然なエキスを選別するのにセルの NCI-60 セットが使用されていたので 「私達はどんな混合物が他のタイプの癌があるかもしれない実質の患者でされましたと」 Theodorescu 言った動作するかもしれませんかについての重要な予言を。 研究者は 45,545 の混合物を選別するのに COXEN を使用し人間の膀胱癌に対して作業がある複数の新しい混合物を識別しました。 科学界とこのエキサイティングな機能を共有するためには、リー先生は癌細胞または忍耐強い腫瘍からの genomic 側面図を描くデータの調査官が FDA 公認の化学療法の混合物の chemosensitivity の予言の結果を得ることができるところ WEBベース COXEN システム (www.coxen.org) の開発を導いています。

Theodorescu 先生は膀胱癌に対して新しい混合物のために臨床試験を計画しています。 別の計画された臨床試験は FDA 公認のエージェントを使用して癌を個人化なった、 COXEN を受け取るいろいろな癌を持つ患者打つために、二番目のラインの薬剤の組合せを検査します。 多くの新しく、エキサイティングな発見はさらにもっとすぐにより低いコストで、なされることを残ります。

http://www.virginia.edu