As Pacientes que sofre de cancro não têm o tempo para desperdiçar. Muitos atravessam diversos tratamentos diferentes, contudo, encontrar um que é mais eficaz contra seu tipo particular de tumor.
Assim, um algoritmo que poderia ajudar ràpida a classificar a informação molecular sobre o tumor particular de um paciente e poderia ajudar a combinar esta informação ao tratamento direito da droga seria uma descoberta do valor enorme. Dan Theodorescu, M.D., Ph.D., uma Universidade do oncologista de Virgínia e o biólogo do cancro, e Lee de Jae, Ph.D., um biólogo computacional e estatístico da bioinformática, abriu caminho apenas tal sistema. Este trabalho envolveu a colaboração com os colegas no Instituto Nacional para o Cancro, em GeneLogic Inc. e na Universidade do Departamento de Informática de Virgínia. Publicaram seus resultados a semana do 23 de julho na Edição Adiantada do Proceeedings da Academia Nacional das Ciências, encontraram em linha.
Usando um painel de 60 diversos, as linha celular humanas do cancro do Instituto Nacional para o Cancro (NCI-60), os pesquisadores planejaram e testaram um algoritmo projetado combinar os melhores tratamentos potenciais para um tumor particular em um paciente particular.
Previamente, as linha celular NCI-60 foram usadas para seleccionar mais de 100.000 compostos químicos para sua actividade anticancerosa. Estes drogam respostas, contudo, não foram ligados definida à eficácia clínica nos pacientes. Outros tema são que as 60 linha celular não incluíram tipos da mais alta importância do cancro (por exemplo, determinados cancros de bexiga, os linfomas, e os câncers pulmonares pequenos da pilha não estavam entre as 60 linhas estudadas).
Os pesquisadores investigados se os dados da sensibilidade da droga das 60 linha celular do cancro poderiam ser extrapolados na informação útil em outras linha celular dos tumores ou do cancro. De facto, encontraram que seu, o sistema da extrapolação do coexpression (COXEN), poderia ser usado para prever exactamente a sensibilidade da droga para linha celular do cancro de bexiga a dois quimioterapias, cisplatin e paclitaxel comuns.
“Mesmo que este grupo da pilha do NCO não era uma enciclopédia exaustiva das células cancerosas, nós encontramos que nós poderíamos usar os dados disponíveis para tirar conclusões sobre outros tipos que da pilha nós explorávamos. O algoritmo é uma pedra de Rosetta para traduzir das drogas NCO-estudadas a toda a outra linha celular ou tumor humano,” diz o Dr. Theodorescu, director do Instituto do Cancro da Próstata de UVa Paul Mellon e do autor superior do estudo. “Nós acreditamos que nós encontramos um modo eficaz personalizar a terapia do cancro.” A equipa de investigação de UVa podia prever as respostas clínicas de pacientes de cancro da mama com tratado com as quimioterapias, o docetaxel e o tamoxifen de uso geral.