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यूरोपीय संघ के लिए कॉल करने के लिए प्रमुख परियोजना शुरू करने के लिए बाहर हमारे सभी प्रोटीन का नक्शा

Published on July 26, 2007 at 2:36 PM · No Comments

जीव अभी भी कोई स्पष्ट विचार नहीं कितने सक्रिय जीनों प्रोटीन के लिए मानव और अन्य जीवों में कोडिंग कर रहे हैं, भले ही कुछ प्रजातियों के लिए पूरी तरह से जीनोम अनुक्रम निर्धारण किया गया है.

इस वजह से केवल जीन और उनके प्रोटीन उत्पादों के कई है किया गया है कि इस समय अपूर्ण कंप्यूटर एल्गोरिदम द्वारा भविष्यवाणी की. प्रोटिओमिक्स के क्षेत्र के लिए सभी एक दिया जीव द्वारा निर्मित प्रोटीनों की खोज करना है. इस तरह proteome नक्शा सटीक संख्या deducing की संभावना लाने, और प्रोटीन के लिए कोडिंग जीनों के जीनोम में स्थान,. यह बस अंत से जीनोम मानचित्रण करने के लिए अंत है क्योंकि यह सभी प्रोटीन का पता लगाने भले ही कुछ बहुत छोटी मात्रा में ही मौजूद हैं, जबकि कुछ विशिष्ट अंगों और / के लिए सीमित कर रहे हैं या केवल कुछ समय के या चरणों में संश्लेषित शामिल से कहीं अधिक जटिल है एक जीव का जीवन.

हालांकि एक हाल ही में यूरोपीय विज्ञान फाउंडेशन (ESF) द्वारा समर्थित कार्यशाला निष्कर्ष निकाला है कि यह अब संभव है कम से कम लगभग एक जीव की पूरी proteome (सभी प्रोटीन के कुल योग) नक्शा है. इस तरह के एक व्यापक नक्शा और प्रोटिओमिक्स प्रौद्योगिकियों कि तेजी से, अधिक संवेदनशील और वर्तमान तरीकों की तुलना में विश्वसनीय और अधिक कर रहे हैं की एक नई पीढ़ी के विकास के लिए और अंततः व्यापक आवेदन एक आवश्यक आधार जाएगा. इन प्रौद्योगिकियों, बारी में, अपने प्रदर्शन में सुधार के लिए धन्यवाद बहुत कई रोगों की समझ में सुधार लाने और नए उपचारों के लिए नेतृत्व सकता है ESF कार्यशाला समन्वयक प्रोफेसर Switerzland में आण्विक जीवविज्ञान सिस्टम के संस्थान से Aebersold रुडोल्फ के अनुसार. कैंसर और कई रोगजनक संक्रमण सहित अधिकांश रोगों, प्रोटीन और उनके बातचीत के बहुतायत में जुड़े परिवर्तन, Aebersold के साथ कोशिकाओं या ऊतकों में विनियामक प्रक्रियाओं के लिए व्यवधान को शामिल बताया. "विचार है कि अगर हम पूरे proteome मानचित्र सकता, हम एक Toolbox assays (प्रोटीन का पता लगाने के लिए) तेजी से और अधिक सस्ते में किया जा करने के लिए सक्षम करने संरचना का विकास कर सकते हैं होगा." यह तब संभव हो सकता है के लिए एक विशेष बीमारी में फंसा और अधिक आसानी से प्रोटीन की पहचान, अनुसंधान के साथ अंतर्निहित कारणों में दोनों मदद चाहते हैं, और अंततः का निदान करने में.

क्यों proteome मानचित्रण भी जीव विज्ञान के और अधिक हाल ही में पहेली का, एक है जो हल करने में मदद करेगा सभी जीवों, सरल से सबसे जटिल प्रयोगात्मक पता लगाया प्रोटीन की तुलना में भविष्यवाणी की प्रोटीन जीन कोडिंग की संख्या काफी अधिक होते हैं. कमी महत्वपूर्ण है, लगभग सभी जीवों में वहाँ के बारे में केवल 65 फीसदी कई प्रोटीन के रूप में जीनोम का विश्लेषण के माध्यम से भविष्यवाणी की गई थी. यह एक आश्चर्य है क्योंकि प्रत्येक जीन एक एक एक के आधार पर एक प्रोटीन के लिए कोड समझ गया था. ने बताया Aebersold, वहाँ यह स्पष्ट विसंगति के लिए कई संभावित व्याख्या कर रहे हैं. सरल स्पष्टीकरण बस प्रोटिओमिक्स तरीकों, जो एक परिणाम के रूप में अभी तक नाकाम हो सकता है प्रोटीन के विशिष्ट वर्गों की पहचान की संवेदनशीलता की कमी है. हालांकि प्रोटिओमिक्स तरीकों की बढ़ती संवेदनशीलता दिया, इस विवरण तेजी की संभावना नहीं है.

एक और संभावना है कि वहाँ के रूप में कई जीनों कोडन के रूप में सोचा गया था नहीं कर रहे हैं. संख्या मज़बूती से अभी तक नहीं है गिना गया, और वर्तमान में कंप्यूटर पहले से ही ज्ञात जीन के अनुक्रम संरचना के ज्ञान के आधार पर भविष्यवाणियों द्वारा अनुमानित है. एक और संभावना है कि वहाँ के रूप में कई जीनों के रूप में सोचा गया था, लेकिन है कि या तो प्रोटीन है कि केवल बहुत कम या विशिष्ट कोशिकाओं या ऊतकों में व्यक्त की शर्तों के तहत, या कि हैं के लिए एक पर्याप्त संख्या कोड mRNA, जो बीच मध्यवर्ती उत्पाद है जीनोम और प्रोटीन के डीएनए, अंतिम प्रोटीन उत्पाद में अनुवाद नहीं है.

Aebersold उम्मीद है कि कार्यशाला में एक प्रमुख यूरोपीय संघ के वित्त पोषित परियोजना के लिए नेतृत्व को पूरा proteomes नक्शा, इन सवालों के कुछ जवाब है, और कैसे जीन मानव और अन्य जीवों में एक और अधिक सटीक गणना पर पहुंचने. "अगर कुछ एक प्रोटीन के रूप में पहचाना जा सकता है है, कि हम कर सकते हैं कि एक जीन वास्तव में मौजूद सबसे प्रत्यक्ष प्रमाण है" Aebersold कहा. हालांकि यह कठिन हो सकता है बताने के लिए जब काम किया है, क्योंकि proteome जीनोम के विपरीत, एक स्थिर, परिभाषित भौतिक इकाई नहीं है. जबकि जीनोम डीएनए के प्रसिद्ध डबल हेलिक्स है कि शारीरिक रूप से एक अंत करने के लिए अंत के आधार पर अनुक्रम किया जा सकता है है शामिल हैं, proteome बस सभी प्रोटीन की कुल है, और इसलिए परिभाषा के द्वारा तुम बिल्कुल यकीन है कि आखरी पाया गया है कभी नहीं हो सकता , यह देखते हुए कि कुछ रहकर या छोटी मात्रा में मौजूद हैं और आसानी से विश्लेषण के दौरान याद किया जा सकता है. मास स्पेक्ट्रोमेट्री इस विश्लेषण करते हैं और जटिल नमूने में प्रोटीन क्रोमैटोग्राफी जैसे कुछ तकनीक बाहर अलग - अलग प्रोटीन को अलग लगाने के बाद की पहचान के लिए प्रयोग किया जाता है. अमीनो एसिड अनुक्रम प्रत्येक प्रोटीन की जुदाई के बाद निर्धारित किया जा सकता है, बिजली के प्रभारी और जन के बीच रिश्ते से.

के रूप में Aebersold विख्यात, प्रोटिओमिक्स के सबसे बड़े पुरस्कार के नमूनों के भीतर व्यक्तिगत प्रोटीन की पहचान के लिए एक बहुत सरल और कुशल तकनीक है, जो अंततः अनुसंधान और जैव प्रौद्योगिकी और औषधि के पूरे क्षेत्र भर विशाल निदान के रूप में के रूप में अच्छी तरह से बिजली अनुप्रयोग हो सकता है किया जाएगा. ESF कार्यशाला यूरोप के लिए सहयोगात्मक ढांचे की स्थापना की मदद करने के लिए पूरी तरह से महान प्रोटिओमिक्स पहल में भाग लेने के द्वारा जमीन तैयार की है, और अब यह यूरोपीय संघ के लिए धन उपलब्ध कराने.

कार्यशाला मॉडल जीव प्रोटिओमिक्स, जो एक ESF खोजपूर्ण कार्यशालाएं द्वारा आयोजित की घटनाओं की श्रृंखला की 11-13 अप्रैल 2007 को आयोजित की गई थी, ज्यूरिख, स्विट्जरलैंड में. प्रतिनिधि को क्षेत्र और यूरोप में यह जगह के राज्य की एक पूरी तरह से अवलोकन दिए गए विभिन्न सफल सहयोग के विवरण के साथ. कार्यशाला के बाद, यूरोप ज्यादा बेहतर है के लिए क्षेत्र में अपने संसाधनों को प्रभावी ढंग से दोहन रखा.

हर साल, ESF लगभग 50 सभी वैज्ञानिक डोमेन में खोजपूर्ण कार्यशालाएं समर्थन करता है. इन छोटे, इंटरैक्टिव समूह सत्रों अनुसंधान के क्षेत्र में नई दिशाओं खोलने के लिए विज्ञान के क्षेत्र में घटनाओं पर एक संभावित प्रभाव के साथ नए क्षेत्रों का पता लगाने के उद्देश्य से कर रहे हैं

http://www.esf.org