Le reti del Gene sono alcune delle funzionalità più fondamentali di un organismo vivente. Un esterno o uno stimolo interno attiva alcuni geni, che a loro volta gestiscono altri geni di cui l'attività gira i vari trattamenti biologici inserita/disinserita (quale il ciclo cellulare, produzione di energia, la riparazione del DNA, suicidio cellulare ecc).
Molte delle funzioni regolarici sono gestite tramite il collegamento delle proteine speciali (fattori di trascrizione) a 6 - 10 sequenze obbligatorie lunghe del nucleotide situate sul DNA, attivante o sopprimente l'espressione del gene regolamentato. La Nostra capacità di identificare queste sedi del legame è essenziale per capire che le reti biologiche di modo funzionino.
Mentre i genoma di vari organismi sono stato conosciuti, è risultato che gli organismi complessi e semplici differiscono meno di quanto anticipato nelle dimensioni e nel trucco dei loro genoma; la complessità di un organismo ora è creduta per essere riflessa pricipalmente nel modo in cui l'espressione è regolamentata. Secondo il consenso, la trascrizione dei geni umani è regolamentata principalmente dai fattori che legano ai siti di cui le distanze dal sito di inizio della trascrizione possono variare ampiamente e raggiungono decine di migliaia di coppie di basi.