Trzy roku temu, "ultraconserved elementy" odkrywali w genomach myszy, szczury i istoty ludzkie.
Te są DNA sekwencje podstawowe pary w długości długich lub -- niektóre są nad 700 podstawowych par długim seansem 100 procentów tożsamością wśród trzy gatunków. Doskonale chronili od ostatniego pospolitego antenata myszy, szczury i istoty ludzkie które żyli niektóre 85 milion rok temu.,
Te i inne wysoce chronić sekwencje myśleć upierać się z mało lub wcale zmiany ponieważ są niezbędni, wykonujący funkcjonują zasadniczy dla rentowności lub reprodukci. Naukowowie w Genomics podziale dział energia Lawrance Berkley królicy i narodowego laboratorium joint genome institute wykładali badać ten hipotezę konstruować cztery różnych "nokautowych" myszy, each brakuje jeden wybierający ultraconserved element.
Jeżeli szczerze coś niezbędnego, myszy brakuje ultraconserved element musi lub umiera lub jest niezdolny produkować wykonalnych potomstwa. Znacząco, gdy badacze donoszą w Wrześniu, 2007 zagadnienie ploso biologia nokautowe myszy w ten nauce pokazywał prawie żadny chorych skutki wcale.
"Dla my, to był naprawdę zaskakuje rezultat," mówi Nadav Ahituv Berkley Lab Genomics królicy i podziału JGI, ludzki genetyk który prowadził eksperyment. "w pełni oczekiwaliśmy demonstrować zasadniczego rola pokazywać te ultraconserved element sztuka co zdarza się gdy brakują. Zamiast, nasz nokautowe myszy byli nie tylko pokazywać żadny krytyczne anormalność w, wykonalne ale żyzne przyroscie, długowieczności, patologii lub metabolizmu i."
Edward Rubin dyrektor joint genome institute i Berkley Lab Genomics podział, powiedział, "Wiele naukowowie spekulował, który kierowali naukę, że powód dla absolutnej tożsamości sekwencje nad 80 milion rok od istot ludzkich i ślepuszonek różniących się był że te sekwencje są kluczowe dla życia: jeżeli baza zmienia organizm umierał, tak, że jest dlaczego widziimy całkowicie żadny sekwencj zmiany w te regionach. Rezultaty ten nauka wyraźnie pokazują że to no jest skrzynka. Podczas gdy no myśleć możemy wnioskować że myszy są normalne, my mogą pewnie wnioskować że obecność ultraconserved elementy no wymaga dla rentowności organizm." tworzyliśmy z ultraconserved elementami kasującymi
Niektóre 481 ultraconserved sekwencje w istotach ludzkich, szczury, i myszy są cyfrowań sekwencjami, geny które kodują dla protein, nad połówką ale, określającą noncoding ultraconserved elementy, no są. Poprzedzający studia Berkley Lab badaczami i ich kolegami sugerowali znacząco rola dla te noncoding sekwencj w genu przepisie; ponieważ postępują promować wyrażenie geny znają jak "enhancers."
Dla ten nauki drużyna specyficznie wybierał cztery ultraconserved noncoding elementu, myśl być enhancers niedalecy geny które gdy mutujący prowadzenie surowe rozwojowe anormalność lub plenność problemy.
Na przykład, noncoding ultraconserved element liczba 467 731 podstawową parę która są identyczna wśród istoty ludzkiej, myszy i szczura; sekwencja (uc467) ja jest jeden długi wszystkie ultraconserved elementy wśród nasz genomu. Uc467 myśleć być enhancer dla ARX i w istotach ludzkich powoduje szerokiego zakres nieład, gen który neurologiczni i rozwój., gdy brakowy w myszach, zakłóca męskiego plciowego rozwój i powoduje śmiercionośne móżdżkowe anormalność,
Używać standardowe myszy inżynierii genetycznej techniki badacze brakuje jeden wybierający ultraconserved elementy przygotowywali cztery linii nokautowe myszy, each typ.
"znaliśmy że pukający out geny themselves prowadzi lethality lub plciowe anormalność w myszach, i czasem inni problemy," mówi Ahituv. "W ten sposób oczekiwaliśmy że myszy brakuje ultraconserved sekwencje które myśleć regulować te geny produkują podobnego wynika: lethality lub nieurodzajność."
Zamiast oczekiwać drastycznych rezultatów, jakkolwiek, wszystkie cztery linii nadplanowej normalnej ściółki zdrowe myszy. Ich ciężar był normalny podczas 10 tygodni monitorowanie; myszy oglądali dla sześć miesięcy, nie tylko ximpx i prosperowali. (i teraz byli oglądający dużo dłudzy, dużo) Poddawali mnodzy kliniczni assays bez znaków anormalność, i żadny znaczące różnicy porównywali typ kontrola.
Tam jest obfitość który wysoce chronił sekwencje wykonuje zasadnicze funkcje, "dowód" mówi Ahituv. "Naprawdę, lokalizować noncoding sekwencje które byli niewymienione ewolucją jest jeden główny narzędzie naukowów use znajdować znacząco czynnościowych elementy w genomu."