Tre år sedan, ”upptäcktes tjaller ultraconserved beståndsdelar” i genom av möss, och människor.
Dessa är DNA ordnar 200 baserar parar i längd eller longer -- några är över 700 baserar parar lång visning 100 procent identitet bland den tre arten. De har perfekt bevarats, sedan den sist allmänningförfadern av möss, tjaller, och människor, som bodde något 85 miljon år sedan.
Dessa och annat som bevaras högt, ordnar tänks för att ha framhärdat med litet eller inget ändring, därför att de är oumbärligt ting och att utföra fungerar livsviktigt för viability eller reproduktion. Forskare i GenomicsUppdelningen av Avdelningen av Energis Laboratoriumet och DOE'SEN för den Lawrence Berkeley Medborgare Fogar Ihop GenomInstitutuppsättningen ut för att testa denna hypotes, genom att iscensätta fyra olika ”knockout-” möss, varje som saknar en utvald ultraconserved beståndsdel.
Om riktigt oumbärliga, bör möss som saknar en ultraconserved beståndsdel, endera dö eller vara oförmögna till livsdugliga avkommor för jordbruksprodukter. Remarkably, som forskarna anmäler i Septemberet, utfärdar 2007 av PLoS Biologi, de knockout- mössna i denna studie visade nästan verkställer inte dåligt alls.
”För oss, denna ett egentligen var att förvåna resultat,” något att säga Nadav Ahituv av det Berkeley Labb Uppdelning för Genomics och DOES JGI, en människagenetiker som ledde experiment. ”Förväntade Vi fullständigt att visa den livsviktiga rollen lek för dessa ultraconserved beståndsdelar vid visning vad händer, när de är saknade. I stället var våra knockout- möss inte endast livsdugliga och fertila utan visat inga kritiska abnormalities i tillväxt, livslängd, patologi eller ämnesomsättning.”,
Edward Rubin, Direktör av det Gemensamma GenomInstitutet och det Berkeley Labb Uppdelningen för Genomics, som riktade studien, sade, ”Många forskare hade spekulerat att resonera för evig sanningidentitet av ordnar över de 80 miljon åren efter människor och avvek rodents var att dessa ordnar är avgörande för liv: om en basera ändrar, skulle organismen matrisen, så att är därför vi ser absolut inget för att ordna ändringar i dessa regioner. Resultaten av denna studie visar klart att detta inte är fallet. Stunder gör Jag inte funderare som vi kan avsluta att mössna vi skapade med de borttagna ultraconserved beståndsdelarna är det normala, oss kan säkert avsluta att närvaroen av de ultraconserved beståndsdelarna inte krävs för viabilityen av organismen.”,
Några av de ultraconserved 481na ordnar hos människor, tjaller, och möss kodifierar ordnar, gener, som kodifierar för proteiner, men över halvan som benämnas noncoding ultraconserved beståndsdelar, är inte. Föregående studier av de Berkeley Labbforskarna och deras kollegor har föreslågit att en viktig roll för dessa som noncoding ordnar i genreglering; därför att de agerar för att främja uttryckt av gener, är de bekant som ”enhancers.”,
För denna studie valde laget specifikt fyra ultraconserved noncoding beståndsdelar, tanke för att vara enhancers av närliggande gener som när muterat bly- till stränga utvecklings- abnormalities eller fruktsamheta problem.
Till exempel numrerar den noncoding ultraconserved beståndsdelen 467 (uc467) har 731 att basera parar av ordnar som är identisk bland människan, mus, och att tjalla; den är en av de längsta allra ultraconserved beståndsdelarna inom vår genom. Uc467 tänks för att vara en enhancer för ARX, en gen, som, när det är defekt i möss, störer male sexuell utveckling och orsakar dödliga hjärnabnormalities, och orsakar hos människor en lång räcka av neurological och sexuell-utveckling oordningar.
Genom Att Använda standarda musgentekniktekniker, fodrar forskarna förberedda fyra av knockout- möss, varje typ som saknar en av de valda ultraconserved beståndsdelarna.
”Visste Vi, att knacka ut blytaket för gener sig själv till lethality eller sexuella abnormalities i möss och ibland andra problem,” något att säga Ahituv. ”Så förväntade vi att möss som saknar ultraconserved ordnar som tänks för att reglera dessa gener skulle jordbruksprodukter ett liknande resultat: lethality eller infertility.”,
I stället för de förväntade drastiska resultaten emellertid, fodrar alla fyrana producerade det normalakullar av sunda möss. Deras väga var det normala under 10 veckor av övervakning; mössna hölls ögonen på för halvår (och av nu, har många hållits ögonen på mycket longer) och fortlevdes inte endast utan blomstrades. De betvingades till talrika kliniska analyser med inget tecken av abnormality, och inga viktiga skillnader jämförde till wild-typen kontrollerar.
”Finns Det överflöd av bevisar som bevarade högt ordnar utför livsviktigt fungerar,” något att säga Ahituv. ”Sannerligen och att lokalisera noncoding ordnar som har varit oförändrad vid evolution är en av de huvudsakliga bearbetar forskarebruk att finna viktiga funktionella beståndsdelar i en genom.”,