Een nieuwe studie gepubliceerd in Nature Genetics op zondag 16 september 2007 blijkt dat gemeenschappelijke, complexe ziekten hebben meer kans om als gevolg van genetische variatie in de regio's dat de controle-activiteit van genen, in plaats van in de regio's die het eiwit code te geven.
Dit verrassende resultaat komt uit een studie aan de Wellcome Trust Sanger Instituut van de activiteit van bijna 14.000 genen in 270 DNA-monsters verzameld voor de HapMap Project. De auteurs keken 2,2 miljoen DNA-sequentie-varianten (SNP's), waaraan betrokken genactiviteit te bepalen.
Zij vonden dat de activiteit van meer dan 1300 genen werd beïnvloed door de DNA-sequentie veranderingen in de regio voorspeld te worden betrokken bij het reguleren van gen-activiteit, die vaak liggen dicht bij, maar buiten, het eiwit-coderende gebieden.
"We voorspellen dat varianten in de regelgeving regio's een grotere bijdrage aan de complexe ziekte dan wel varianten die eiwitsequentie invloed zijn," verklaarde Dr Manolis Dermitzakis, senior auteur van de Wellcome Trust Sanger Institute. "Dit is de eerste studie op deze schaal en deze resultaten zijn bevestiging van onze intuïtie over de aard van de natuurlijke variatie in complexe eigenschappen.
"Een van de uitdagingen van de grootschalige studies die een DNA-variant link naar een ziekte is om te bepalen hoe de variant van de ziekte veroorzaakt: onze analyse zal helpen om dat begrip, een essentiële stap op het pad van genetica tot verbeteringen in de gezondheidszorg te ontwikkelen. "
Eerdere studies van zeldzame, monogene ziekten, zoals cystische fibrose en sikkelcelanemie, hebben zich gericht op veranderingen in de eiwit-coderende gebieden van genen, omdat ze zijn zichtbaar voor de instrumenten van de menselijke genetica. Met de HapMap en grootschalige onderzoeksmethoden, kunnen onderzoekers inspecteren de rol van de regio's die de activiteit van vele duizenden genen reguleren.
De HapMap Project opgericht celculturen van deelnemers uit vier bevolkingsgroepen, alsmede, voor enkele voorbeelden, informatie van de familie, die kunnen helpen om overerving van de genetische variatie te begrijpen. Het team gebruikte deze middelen om gen-activiteit in de cel culturen te bestuderen en dat koppelen aan DNA-sequentie variatie
'We hebben gegenereerd een bron van informatie gemakkelijk beschikbaar voor onderzoekers die werkzaam zijn in het in kaart brengen van de varianten onderliggende complexe eigenschappen. Regio's van vereniging kan worden gecorreleerd met de handtekeningen van regulerende gebieden die genexpressie "verklaarde Dr Panos Deloukas, senior onderzoeker aan het Wellcome Trust Sanger Institute