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蛋白質アーキテクチャは生命の歴史で Windows を提供します

Published on October 2, 2007 at 1:16 AM · No Comments

現在はたくさん過去、しかしあなたについてどこを見るか確認する必要がありなさいことを告げることができます。

ゲノムの研究で今月現われる新しい調査は蛋白質アーキテクチャ - 蛋白質内の特定の領域の三次元構造生命の歴史で - が異常な Windows を提供することを明らかにします。

調査では、イリノイ大学の研究者は発展の歴史で 「分子化石」か 「歴史的押印」として現代的な蛋白質アーキテクチャをそのマークの重要なマイルストーン記述します。 調査チームは蛋白質アーキテクチャの全体的な人口調査をコンパイルし、生命の 3 superkingdoms のそれぞれの出現、多様化および洗練を計画するのにこれらの遺物を使用しました: Archaea、細菌および Eukarya。

すべての蛋白質は建築要素で、互いへの構造および機能類似によって識別することができる領域と呼出されて構成されます。 蛋白質の領域はべきであるようにより大きい蛋白質の機械装置が作用するようにするギヤ、ベルト、ばねおよびモーターです。 あらゆる蛋白質はそれらの 1つ以上を含み、非常に異なったタスクを行う蛋白質は同一の領域を含むことができます。

蛋白質の領域はフォールドグループと呼出され、 superfamilies を折ることがにグループ化されます。 フォールドの superfamily のメンバーは根本的なアミノ酸シーケンスで異なるかもしれませんが構造および機能類似を保ち、 evolutionarily 関係しています。 フォールドの superfamilies はフォールドと呼出される広いカテゴリに一緒にグループ化されます。

新しい調査は古代世界からの現在にフォールドそしてフォールドの superfamilies の改革を追跡します。

蛋白質のフォールドは一定時間にわたりかなり安定しているので、言いました調査の穀物科学のグスタボ Caetano-Anollés、教授および主任調査官を発展のイベントの信頼できるマーカーであることをなります。 それらのためにコードする遺伝子の突然変異はまれに三次元構造を変更しません。

「世界の歴史の重要な発見だったので構造非常に節約されたと」、は Caetano-Anolless 言いましたです。 する既存の構造が既に」。ことができない方法で何かをするために 「新しいデザインを思い付くことは非常に困難です

蛋白質のフォールドが非常に精製されるおよび深く適用範囲が広い機械はそれらのそう少数があるという事実によってサポートされますという考え。 科学者は完全なゲノムが配列されたすべての有機体を渡る約 1,000 のフォールドそして 1,500 のフォールドの superfamilies だけ識別しました。 これらの蛋白質のフォールドの多数はあらゆる有機体にあります。 他のフォールドは organismal 生命のある特定のサブセットでだけ現われます。

イリノイのチームの調査結果は発展の発散の初期についての長く、好戦的な討論に新しい次元を追加します。 genomic 情報が使用できるすべての有機体を渡る蛋白質アーキテクチャを見ることによって、チームは archaeal 微生物、惑星の最も近寄り難い環境のいくつかに居住する 1 celled 有機体が、 evolutionarily 区別可能なグループとして現れる第 1 だったという証拠を見つけました。 証拠: Archaea として知られていた superkingdom に 1 日属するアーキテクチャのレパートリーはフォールドを失う第 1 でした。 フォールド、 archaeal 血統から単に全体で消える蛋白質のフォールドの superfamilies の巨大なクラス、こと。

最終的に、ますますフォールドは放棄されたアーキテクチャのリストを著者が 「reductive 改革のプロセスとして」。記述するものをの Archaea によって、結合しました 私達が今細菌と呼出し、多細胞の真核生物がまたフォールドを失い始めたことをに結局展開した有機体に属するフォールドレパートリーを Archaea より大いにあとで小型化し始めましたが。

これ前に、著者は、蛋白質のフォールドの世界で大きく、多様書きま、使用中のフォールドアーキテクチャの多数を今日まだ含んでいます。 これは 「コミューンの祖先の時」、前に結局各グループを位置付ける無数の有機体および superkingdoms の出現でした。

蛋白質アーキテクチャのこの概要は映像に superkingdoms がどのようにの現れ、それたか追加します。 Archaea はずっと元の相続財産の部分であるフォールドの多数を捨てました。

グループとして、細菌は寄生虫または寄生虫を義務づける細菌がフォールドの最小主義のレパートリーだけ保ったが、少数のフォールドを失いました。 作戦はホストで使用できる蛋白質の機械装置を利用することでした。