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帕扎尔 - 基因调控数据的虚拟集市

Published on October 4, 2007 at 12:59 PM · No Comments

一个国际研究小组已经开了一个虚拟集市,称为帕扎尔,这使得生物学家通过单独管理的“精品店”(数据集合)有关的基因调控的信息共享。

根据研究发表在网上开放存取期刊,基因组生物学,客户可以访问的数据没有任何负责任何精品或提取信息,从“超级广场”,相似类型的汇总数据。

在破译人类基因组序列,研究人员希望了解何时何地的基因表达,因为这可以加快开发新的癌症疗法或干细胞治疗退行性疾病,并解释复杂的疾病,如糖尿病。

在昂贵的基因调控研究收集到的信息大多是很差,如果可在所有访问。个人的研究团队,往往会产生在互联网上的数据库或邮寄文件,但这些数据分散,可随着时间的推移丢失。该研究小组,由惠氏沃瑟曼在不列颠哥伦比亚省和儿童与家庭研究所,加拿大温哥华,和来自保加利亚,加拿大,法国,和美国的同事大学领导,一起把它描述一个新的方法来管理这个信息首次使用帕扎尔。

帕扎尔是,研究人员解释,“开放式访问和开源数据库的转录因子和调控序列注解”。因此,它满足了一个大的商业机构不受限制的调控序列数据收集的长期需要。其新颖的购物商场(商场帕扎尔是保加利亚)状结构将允许研究人员在一个有组织和通俗易懂的方式共享数据收集和计算预测。

为了证明的优势和特点帕扎尔及其注释的深入,研究人员使用大脑相连的调控序列的昴宿星团推广项目的集合,作为一个出现。他们一直工作在国际精品运营商,并正在扩大数据代表,并改进打捞工具。把小的数据集合在一起沃瑟曼和他的同事的目标是使国际科学客户的数据,并鼓励其他研究人员打开新的精品店,在这个基因组的商场。

http://www.biomedcentral.com/