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帕扎爾 - 基因調控數據的虛擬集市

Published on October 4, 2007 at 12:59 PM · No Comments

一個國際研究小組已經開了一個虛擬集市,稱為帕扎爾,這使得生物學家通過單獨管理的“精品店”(數據集合)有關的基因調控的信息共享。

根據研究發表在網上開放存取期刊,基因組生物學,客戶可以訪問的數據沒有任何負責任何精品或提取信息,從“超級廣場”,相似類型的匯總數據。

在破譯人類基因組序列,研究人員希望了解何時何地的基因表達,因為這可以加快開發新的癌症療法或幹細胞治療退行性疾病,並解釋複雜的疾病,如糖尿病。

在昂貴的基因調控研究收集到的信息大多是很差,如果可在所有訪問。個人的研究團隊,往往會產生在互聯網上的數據庫或郵寄文件,但這些數據分散,可隨著時間的推移丟失。該研究小組,由惠氏沃瑟曼在不列顛哥倫比亞省和兒童與家庭研究所,加拿大溫哥華,和來自保加利亞,加拿大,法國,和美國的同事大學領導,一起把它描述一個新的方法來管理這個信息首次使用帕扎爾。

帕扎爾是,研究人員解釋,“開放式訪問和開源數據庫的轉錄因子和調控序列註解”。因此,它滿足了一個大的商業機構不受限制的調控序列數據收集的長期需要。其新穎的購物商場(商場帕扎爾是保加利亞)狀結構將允許研究人員在一個有組織和通俗易懂的方式共享數據收集和計算預測。

為了證明的優勢和特點帕扎爾及其註釋的深入,研究人員使用大腦相連的調控序列的昴宿星團推廣項目的集合,作為一個出現。他們一直工作在國際精品運營商,並正在擴大數據代表,並改進打撈工具。把小的數據集合在一起沃瑟曼和他的同事的目標是使國際科學客戶的數據,並鼓勵其他研究人員打開新的精品店,在這個基因組的商場。

http://www.biomedcentral.com/