研究者は同様に苛立たせる (はるかに関連した) genomic 質問に答え、: たくさんのヒトゲノムの繰り返された DNA の長い伸張のどれが最初に来ましたか。 そして複写であるか。
答え、 2007 年 10 月 7 日に元来オンラインで出版された遺伝学は、病気および最近の遺伝の革新両方に部分的に責任があるヒトゲノムの重複の最初の発展の歴史を提供します。 これらの重複が発生したおよびものの準の費用が - である時、どんな genomic 変更が現代人間のための道を開いたかこの著作記号よりよい理解の方の重要なステップ病気引き起す遺伝の突然変異かへの耐障害性の点では…。
ゲノムに 1 本の染色体からの DNA の長い伸張をコピーし、ゲノムの別の領域に挿入する驚くべき機能があります。 繰り返された DNA の生じる固まり - 呼出された 「部分的な重複」 - は多くの発展の秘密およびそれらを覆いを取ることをです改革の薬そして私達の理解両方のための含意を用いる困難な生物的および計算の挑戦保持します。
性質の遺伝学で出版される新しい発展の歴史は医科大学院ワシントン大学から生物学者および Pavel Pevzner、サンディエゴカリフォルニア大学からコンピューター科学者によってエバン Eichler 導かれるインタディシプリナリ・チームからあります。
以前、 DNA の重複の非常に複雑なパターンは - 重複内の重複を含んで - これらの長い DNA の重複の発展の歴史の構築を防ぎました。
およびコピー (派生的な重複)、アルゴリズムの生物学および比較ゲノミクス両方に見る研究者はであるかどれ重複を割るためにはコードし、オリジナル (先祖の重複) は DNA セグメントのどれであるか定めて下さい。
「元の重複を識別することはヒトゲノムを不安定にさせるものが理解への前提条件」、言いました Pavel Pevzner を DNA の繰り返された伸張のモザイクを解体し、オリジナルシーケンスを識別するためにアルゴリズムのゲノムアセンブリ技術を修正した UCSD コンピュータ・サイエンス教授です。 「どんな原因特別な何かがヒトゲノムのこの植民地化」、か多分にオリジナル、糸口または洞察力についてあります Pevzner を言いました。
「これは最初に」、言いましたペーパー、著者エバンを Eichler およびハワード・ヒューズの医学の協会医科大学院ワシントン大学からの教授私達にヒトゲノムの最も複雑な領域のいくつかの発展の起源の全体的な概観があることです。
研究者は先祖の起源をのこれらの長い DNA の重複の以上 3 分の 2 見つけ出しました。 性質の遺伝学のペーパーで彼らは 2 つの大きい映像の調査結果を強調します。
最初に、研究者はヒトゲノムの特定の領域が私達の最近の genomic 歴史の異なった時に重複の作業の高いレートを経験したことを提案します。 これは最近の重複のための連続モデルを提案する genomic 重複のほとんどのモデルと対比します。
2 番目に、研究者は部分的な重複を形作ることを一緒に来られる DNA の 「コア duplicons」の - 短いセグメントの幾分小さいサブセットのまわりでそれに大部分の最近の重複アーキテクチャ中心を示します。 これらのコアは人間の遺伝子/コピーの革新の焦点です。
「私達はヒトゲノムの重複すべてが作成された同輩ではないことが分りました。 そのうちのいくつかは - コア duplicons - ヒトゲノムでであるある」、アルゴリズムおよびシステムズ生物学のための UCSD の中心のディレクター Calit2 の UCSD の部分に説明された Pevzner の最近の遺伝の革新に責任がありますようです。
著者は 14 のそのようなコア duplicons の覆いを取りました。