Badacze odpowiadali podobnie drażni genomic pytanie: (i daleko istotny) Co tysiące długie rozciągliwość częstotliwy DNA w ludzkim genomu przychodził najpierw? I które są duplikatami?
Odpowiedzi, publikować online natur genetyka na Październiku 7, 2007, zapewniają pierwszy ewolucyjną historię powielania które są częsciowo odpowiedzialni dla choroby i niedawnych genetycznych innowacj. w ludzkim genomu Ten pracy oceny, gdy te powielania zdarzali się jaki, co genomic zmiany brukowali sposób dla nowożytnych istot ludzkich znaczący krok w kierunku lepszy zrozumienia i kojarzoni koszty są - pod względem podatności powoduje genetyczne mutacje.
Genomy wybitną zdolność kopiować długą rozciągliwość DNA od jeden chromosomu i wkładać je w innego region genom. Wynikli kawały częstotliwy DNA trzymają wiele ewolucyjnych sekrety i odkrywać one są trudnym biologicznym, obliczeniowym wyzwaniem i. - nazwani "członowi powielania" - medycyny i nasz zrozumienia ewolucja z następstwami dla
Nowa ewolucyjna historia, publikująca w natur genetyka, jest od interdyscyplinarnej drużyny prowadzącej biolożką Evan Eichler od university of washington szkoły medycznej Pavel Pevzner od uniwersyteta kalifornijskiego komputerowych naukowów i, San Diego.
W przeszłości wysoce powikłani wzory DNA powielanie zapobiegali budowę ewolucyjna historia te długo DNA powielania. - wliczając powielań wśród powielań -
_ pękać the powielanie kodować i ustalać che the DNA segment być oryginał (ancestralny powielanie) i che być kopia (derywacyjny powielanie), the badacz patrzeć algorithmic biologia i porównawczy genomics.
Utożsamiać oryginalnych powielania jest prerequisite rozumieć" powiedział Pavel Pevzner UCSD informatyki profesor który modyfikował algorithmic genomu zgromadzenie technikę deconstruct mozaiki częstotliwe rozciągliwość DNA i utożsamiać oryginał sekwencje po to, aby. "co robi ludzkiemu genomowi niestały," "Być może tam jest coś specjalny o oryginałach, niektóre wskazówce lub wglądzie, w jaki przyczyny ten kolonializacja ludzki genom," powiedział Pevzner.
To jest the first time" powiedział papierowego autor Eichler Evan, profesor od university of washington szkoły medycznej i howard hughes medical institute. "że globalnego widok ewolucyjny początek niektóre skomplikowani regiony ludzki genom,"
Badacze tropili puszek ancestralny początek więcej niż dwa - tercja te dłudzy DNA powielania. W natur genetyka tapetuje je podkreśla dwa dużego obrazka znalezienia.
Najpierw badacze sugerują przy różnymi czasami w nasz niedawnej genomic historii że odmianowi regiony ludzkiego genomu doświadczający wynoszący tempa powielanie aktywność. To kontrastuje z najwięcej modelów które sugerują ciągłego modela dla niedawnych powielań. genomic powielanie
Po drugie badacze pokazują że wokoło raczej małego podzbioru wielka frakcja niedawni powielanie architektury centra "sedno duplicons" krótcy segmenty które przychodzą wpólnie tworzyć członowych powielania. DNA - Te sedno są punktami centralnymi ludzkie genu, kopii innowacje/.
"zakładamy że nie wszystko powielania w ludzkim genomu są tworzącym równy. Niektóre one pojawiać się są odpowiedzialni dla niedawnych genetycznych innowacj w ludzkim genomu," tłumaczony Pevzner lokalizować przy UCSD podziałem Calit2 który jest dyrektorem UCSD centrum dla Algorithmic i systemów biologii. - sedno duplicons -
Autory odkrywali 14 taki sedna duplicons.