Ett år efter att ha avslutat den första storskaliga rapporten sequencing bröst och kolon bröstcancergener, har Johns Hopkins Kimmel Cancer Center forskare studerat den stora majoriteten av protein-kodning gener som nu föreslår ett landskap domineras av gener att varje muterade i relativt få cancer.
Deras rapport, publicerad online i 11 oktober frågan om Science Express, visar att medan lite är känt om dessa mindre vanliga muterade gener, kan de grupperas i kluster enligt deras spridningsvägar.
-Det är gen 'berg' representeras av de som ofta ändras och har varit i fokus för cancerforskning år, delvis eftersom de var de enda gener som känt att bidra till cancer, säger Bert Vogelstein, M.D., en utredare vid Howard Hughes Medical Institute och Medregissören av Ludwig Center vid Johns Hopkins. "Nu kan vi se hela bilden, och det är uppenbart att lägre toppar eller gen"kullar"är den dominerande funktionen."
I en systematisk sökning av 18,191 gener som representerar mer än 90 procent av generna som protein-kodning i det mänskliga genomet--cirka 5 000 fler än i den första skärmen--fann Johns Hopkins forskarna att mest orsakar cancer genmutationer är helt olika och kan variera från person till person. De fann att en genomsnittlig 77 gener är muterade i en enskild tjocktarmscancer och 81 i bröstcancer. Av dessa, cirka 15 sannolikt kommer att bidra till en cancer viktigaste egenskaper, och de flesta av dessa gener kan vara olika för varje patient.
"Femton år sedan sade vi p53-genen var oftast muterade genen i cancer. Det är häpnadsväckande att det är fortfarande sant, säger Kenneth W. Kinzler, Ph.D., professor i onkologi vid Hopkins' Kimmel Cancer Center.
Med inga fler högre frekvens mutationer i horisonten säger utredarna att "Personliga mediciner" kan nu fokusera på mer komplicerade banorna att länkar dessa mindre vanliga muterade gener.
Som ett exempel kartlagt Hopkins laget sökvägen till nio gener mindre ofta muterad i bröst eller kolon cancer. Vart och ett av de gener proteinhaltiga produkter interagerat med ett genomsnitt på 25 andra proteiner, kodas av separata gener också befunnits vara muterade i cancer. Det tyder på att dessa gener Konvergera i liknande banor. "Den hårda del användas för att hitta dessa muterade gener, nu utmaningen blir att koppla dem till särskilda vägar och förstå sin funktion," säger Victor Velculescu, M.D., Ph.D., docent i onkologi vid Johns Hopkins Kimmel Cancer Center.