Het is beter om over dan overzien worden gekeken, vermoedelijk bovengenoemde Mae West. Dit zijn woorden van wijsheid voor genoom gegeven-mijnwerkers van vandaag.
De Gegevens die, ondanks zijn wijdverspreide beschikbaarheid ongemerkt gaan, kunnen buitengewoon inzicht aan het het onderscheiden oog openbaren. Zulke is het geval van een systematische analyse door het Joint Genome Institute van het Ministerie van de V.S. van Energie (DOE JGI) van de massieve achterstand van microbiële genoomopeenvolgingen van de openbare gegevensbestanden. Het onderzoek identificeerde genen die de bacteriën doden die in het het rangschikken proces worden aangewend en een microbiële moersleutel in de werkzaamheden werpen. Het biedt ook een mogelijke strategie voor de ontdekking van nieuwe antibiotica aan. Deze bevindingen worden gepubliceerd in de 19 uitgave van Okt. van de dagboekWetenschap.
In aard, zo gemakkelijk delen de gemengde microben genetische informatie die gebruikend genen om hun species te concluderen op de evolutieve boom van het leven futiel werden verondersteld om te zijn plaatsen. Nu, hebben de onderzoekers bij DOE JGI barrières aan deze genoverdracht door genen gekenmerkt te identificeren die de ontvankelijke bacterie op overdracht, ongeacht het type van bacteriële donor doden. Deze dodelijke genen verstrekken ook betere verwijzingspunten voor phylogenic de bouw de boom-middelen om evolutief verband tussen organismen te verifiëren.
„DOE JGI, bedragen wij verantwoordelijk voor het produceren en het maken openbaar - beschikbare genomen van honderden verschillende microben, de meesten waarvan relevant zijn voor het vooruitgaan van de grenzen van bioenergy, koolstof het cirkelen, en bioremediation,“ bovengenoemde Eddy Rubin, de Directeur van DOE JGI. „Wij realiseerden dat het rangschikken van een genoom als het leiden van een massief experiment in genoverdracht is. Door te controleren welke genen niet konden worden gerangschikt, ontdekten wij barrières om over te brengen.“
„Jachtgeweer“ DNA die op industriële schaal strategie rangschikken impliceert afwijkend typisch DNA van het organisme in handelbare fragmenten, en dan opnemend deze fragmenten in een ontwapende spanning van E. coli, die als verrijking wordt gebruikt cultuur-om enorme hoeveelheden doelDNA te groeien. Het team dat door Rubin wordt geleid toonde aan dat dit het rangschikken proces de transmissie van DNA van één organisme aan een andere nabootst, een mechanisme genoemd horizontale genoverdracht. Dit fenomeen komt in aard voor, die één organisme toestaan om genen van andere organismen te verwerven en te gebruiken. Terwijl dit een uiterst zeldzame gebeurtenis in dieren is, komt het vaak in micro-organismen voor en is één van de belangrijkste bronnen voor de snelle verspreiding van antibiotische weerstand onder bacteriën.