De Nieuwe virusdrug zal bij bewegende doelwitten moeten ontspruiten

De reproductie van het dodelijke hepatitisB virus is afhankelijk van de mobiliteit van één van RNAs van het virus.

Dit wordt getoond door Katja Petzold en de Universiteit van Jürgen Schleucher, Umeå, Zweden, in een artikel in de recentste kwestie van het Onderzoek van dagboek Nucleic Zuren.

Meer dan 300 miljoen mensen helemaal over de wereld worden besmet door hepatitisB virus (HBV), en er zijn 2 miljoen sterfgevallen per jaar. De onderzoekers Umeå hebben de mobiliteit van RNA van het virus, een bezit bestudeerd dat voor HBV noodzakelijk is te reproduceren. Naast Jürgen Schleucher en Katja Petzold, zijn Karin Kidd-Ljunggren van de Universiteit van Lund in Zweden en Sybren Wijmenga van de Universiteit van Nijmegen in Holland medeauteurs van het artikel.

De structuren van proteïnen en nucleic zuren worden gewoonlijk voorgesteld als nog beelden. Nochtans, zijn de de molecules' functies of de interactie met drugs afhankelijk van structurele veranderingen, en het is mogelijk om slechts indirecte conclusies over deze op basis van beelden nog te nemen. De Nuclear Magnetic Resonance (NMR) is de enige technologie die studies van bewegingen in specifieke delen van molecules toelaat. Met de hulp van NMR, zijn het verband tussen de beweging en de functie van molecules in kaart gebracht voor vele proteïnen, maar slechts voor een paar nucleic zuren. Dit is ongelukkig, vooral omdat verscheidene nieuwe klassen van RNA met regelgevende functies onlangs zijn ontdekt. Dit betekent dat RNA nu in meerdere mate nog als actieve regelgever van cellulaire gebeurtenissen, niet slechts een passieve boodschapper voor informatie wordt beschouwd.

Wanneer de nieuwe deeltjes HBV in besmette cellen worden gevormd, moet het virus RNA aan DNA, een proces vertalen dat omgekeerde transcriptie wordt genoemd. Het begint met omgekeerde transcriptase die van het virusenzym aan een sterk behouden structuur van RNA in het virus binden. De auteurs vonden dat de volledig behouden nucleotiden (de bouwstenen van RNA) in dit RNA opvallende patronen van mobiliteit tonen. Dit wijst erop dat deze nucleotiden in vrij RNA tijdelijk de structuren bezoeken die zij in complexen met omgekeerde transcriptases gebruiken, en die hun mobiliteit het binden vergemakkelijkt. Dit betekent dat de drugs naar RNA van het hepatitisvirus aan een moving target worden geleid moeten binden dat.

Deze gedetailleerde bevindingen zijn gebaseerd op de eerste toepassing van een nieuwe NMR methode die bij Universiteit Umeå werd ontwikkeld. De nieuwe methode laat studies van bewegingen in de banden in de molecule van RNA toe die het zijn vorm geven. De methode kan ook voor complexe banden tussen drugkandidaten en proteïnen of nucleic zuren worden gebruikt om de stabiliserende krachten op het atoomniveau nader toe te lichten. Daarom kan dit een zeer belangrijk hulpmiddel in biotechnologie en de ontdekking van nieuwe drugs zijn. Het onderzoeksteam beweegt zich nu op computersimulaties om beelden van de bewegingen in RNA te veroorzaken.

http://www.umu.se