多くの医学の無秩序は廃棄された遺伝子データの山で憂鬱な生活を送るかもしれません

以前は隠された肥満関連の遺伝子はおよび Lucile Packard の小児病院スタンフォード大学の医科大学院の研究者によって古い実験から覆いを取られました。

見つけることは多くの医学の無秩序についての有益な情報が廃棄されたデータの山で憂鬱な生活を送るかもしれないことを提案します。

「私達はそれ以上の遺伝の調査のための候補者の病気の遺伝子に多量の既存の生データを変換するかなり単純な方法を案出しました」 Packard の子供で Atul のビュート、 MD、 PhD、小児科医および小児科の生物情報学のための中心病院長を言いました。 「私達が情報をまとめたときに、私達は既に識別されてしまったが、私達はまたある非常に興味深く新しい予言を」。思い付きましたそれらだけを正確に示せた

調査官は他の研究者が行なった 49 の独立した実験 - 同じような結果を自分自身でもたらしたどれもの結果の比較によってダースつの新しい肥満関連の遺伝子より多くの存在を悩ましませんでした。

また衛生学校にと小児科の補助医学部教授であるビュートは新しい遺伝子の生物的役割をすぐに調査することを計画します。 研究はジャーナル生物情報学の 10 月 5 日先発アクセスセクションで現われます。

複雑な病気のための新しい遺伝の被告人を識別して肥満、糖尿病を好めば自閉症は厄介です。 ちょうど 1 つの遺伝子で突然変異によって引き起こされる嚢胞性線維症とは違って、これらの条件は頻繁に相互作用の遺伝子の 「完全な嵐」の結果および環境要因です。 この複雑さは他の候補者を後ろ残す彼らの最も有望な結果だけ追求する限られた時間を研究者に残します。

未使用データを管理することは非常に挑戦的である場合もあります。 マイクロアレイか遺伝子チップは実験します、例えば、数万の情報を生成して下さい。 ほとんどの学術雑誌は著者が共用利用可能の国際的なデータベースにデータすべてを入れるように要求するのでビュートは推定しまそのようなデータのボリュームがであることを毎年倍増するか、または三倍になります。

ビュートおよび彼の同僚、学生の Sangeeta の博士課程終了後の英語、 PhD の人間からのラットワームににいろいろな動物の異った方法を使用して行なわれる 49 の実験からの再分析された共用利用可能データ。 彼らは広いネットを投げました: 調査が公有地で持っていた唯一の事は脂肪質の記憶かサイズにとって重要な遺伝子か蛋白質を探し出すように彼らがそれぞれ設計されていたことでした。

「私達は仮定をしません」、ビュートを言いました。 「私達は彼らの実験のための考え抜かれたモデルを都合するために個々の調査官を信頼しました。 私達が精密で失うかもしれない何を -、例えば、見落としの種特定の相違 - 私達は一般化する機能で得ます。 重要ように私達が基本的な重要性をもつためにが本当らしい」。識別するそれらの遺伝子

例えば、極めてまれな小児科の無秩序に焦点を合わせた 1 つの実験は progeria を呼出しました。 条件の子供は通常急速に老化し、彼らの早い十代の若者たちに停止するようです。 彼らはまた彼らの脂肪細胞を失うことを起こります。 「今、私達はこれが肥満に関与しているかどうか」言いましたビュートを知りません。 「しかし脂肪質の新陳代謝に完全に関係したにあれば、それは何かを私たちの知る限りでは貢献するかもしれません」。

ビュートおよび英語は実験のペアそして信頼できる実行者を識別するために小さいグループを組み合わせました。 前提は 1 つの実験の弱く陽性だけの遺伝子が手から容易に退去するかもしれないことでした。 ただし、その同じ遺伝子が 2つ以上の実験で弱く肯定的なら、それに対する言い分は - 特に結果を生成すればのにそれらの実験が非常に異った方法を使用したら大いにより強くなります。

研究者の技術はまた互いを取り消すとあらゆる実験で、見つけられる許可によってそれ以上の調査のための前にプラスではない遺伝子を選べますかもしれ背景 「騒音」、か無意味な変化の高く立つ本当の陽性を残します。 効果は好みの交響曲を聞くために飛行機の騒音取り消すヘッドホーンのペアを身に着けていることと同じようにあります。

研究者は知っていましたほぼ 300 の前に識別された肥満関連の遺伝子の約 66% 正確に示したときに正しい軌道にあったことを。 それに対して、個々の実験のどれも同じパネルの 30% 以上識別しなかったし、平均実験は 2% だけ識別しました。

それ以上の分析はまたはより多くの実験で肯定的だった、および 8 つの実験で肯定的だった 3 つを 6 つ識別しました 16 の遺伝子を。 それらの 3 の、 1 つは知られていた肥満の遺伝子でした。 他の 2 つに肥満と知られていた結びつきが、けれどもありません。 「今私達は遺伝学者にこれら二つの候補者をまっすぐに連れて行ってもいく、することを把握し始める実験室」、ビュートを言いました。

比較のアプローチは他の多くの無秩序に適当なべきです。 「データそこにあります」、はそれ以上の調査の準備で広大な量の生物医学的な情報を分類し、指標をつける方法を開拓したビュートを言いました。 「私達はそれを変換し、他の研究者および無秩序のために有用にさせる必要があります」。

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