Poprzednio chujący odnosić sie geny odkrywali od starych eksperymentów badaczami przy uniwersytet stanforda szkołą medyczną i Lucile Packard Children szpitalem.
Znalezienie sugeruje że pożytecznie informacja o wiele medycznych nieład może marnieć w górach odrzucający dane.
"wymyślaliśmy całkiem prostego sposób nawracać duże ilości istniejący surowi dane w kandydat choroby geny dla dalszy genetycznej nauki," powiedział Atul Butte, MD, PhD, pediatra i dyrektora szpitala centrum dla Pediatrycznego Bioinformatics, przy Packard Children. "Gdy stawiamy informację wpólnie, byliśmy nie tylko sprawnie dokładnie określać tamto które już utożsamiali, ale także przychodziliśmy up z niektóre bardzo ciekawi nowymi przepowiedniami."
Oficery śledczy dokuczali out istnienie więcej niż tuzin nowych odnosić sie genów porównywać rezultaty 49 niezależnych eksperymentów prowadzących innymi badaczami - nikt z czego mieć poddający się podobni wyniki samodzielnie.
Butte, który jest także asystentem profesora medycyna pediatrie i przy szkołą medyczną, planuje prowadzić dochodzenie biologicznych rola nowi geny wkrótce. Badanie pojawiać się w Oct. 5 postępu dojazdowej sekci czasopisma Bioinformatics.
Identyfikowanie nowatorscy genetyczni winowajcy dla skomplikowanych chorob lubią otyłość, cukrzyce i autyzm jest chytry. W przeciwieństwie do torbielowej łykowatości która powoduje mutacją w właśnie jeden genie, te warunki są rezultatem często "doskonalić burzę" oddziałać wzajemnie geny i środowiskowych czynników. Ten złożoność opuszcza badaczów z limitowanym czasem dążyć tylko ich obiecujących rezultaty, opuszcza innych kandydatów behind.
Kierować nieużywanych dane może niezwykle rzucać wyzwanie. Microarray lub układ scalony eksperymentujemy, na przykład, wytwarzamy dziesięć tysiące informacje. Ponieważ najwięcej czasopism naukowych wymagają autorów przedkładać wszystko ich dane publicznie - dostępne międzynarodowe bazy danych, Butte kosztorysy że pojemność taki dane jest podwajająca każdego roku lub trojąca.
Butte i jego kolega, postdoctoral ucznia Sangeeta angielszczyzny, PhD, analizujący publicznie - dostępni dane od 49 eksperymentów prowadzili używać różne metody w różnorodność zwierzętach od istot ludzkich szczury dżdżownicy. Ciskają szeroką sieć: Jedyna rzecz był studia w błoniu że byli each projektującym myszkować out geny lub proteinami znacząco gruby rozmiar magazynu lub ciała.
"no robimy jakaś przypuszczeniom," powiedział Butte. "ufaliśmy indywidualnych oficerów śledczych wchodzić na górę z dobrze pomyślany modelami dla ich eksperymentów. Co gubić w precyzi możemy - obok, na przykład, przegapiający specyfik różnicy - zyskujemy w zdolności generalizować. Tamte geny który utożsamiamy jesteśmy prawdopodobni być fundamentalna ważność." gdy znacząco
Na przykład, jeden eksperyment skupiający się na bardzo żadki pediatrycznym nieładzie dzwonił progeria. Dzieci z warunkiem pojawiać się starzeć się wartko i zazwyczaj kostka do gry w ich wczesnych wiekach dojrzewania. Także zdarzają się gubić ich grube komórki. Teraz, no znamy" powiedzieliśmy Butte. "jeżeli to coś robić z otyłością," Ale ja może przyczyniać się coś nasz wiedza. "jeżeli ono wcale odnosić sie gruby metabolizm,"