分子ドッキングは酵素の機能をロック解除します

ロックへのキーに簡単なタスクのようにようであるテキサス A&M 大学の研究者は酵素の機能をロック解除するためにたくさんのキーをテストすることを含む調査結果は薬剤デザインの新しいターゲットのためのドアを開くことができます方法を使用して。

フランク Raushel テキサス A&M の研究者は基板と呼出されるどの分子が処置に酵素を誘発するか予測するために 「分子ドッキング」と呼出された技術を修正した科学者のチームの部分で、単独で構造に基づいて酵素の機能を解読することをそれらが可能にします。

チームのペーパーはジャーナル性質で出版されました。

ほとんどの生物学的過程は化学反応を高速化するが、多くの酵素の機能はミステリーに残ります蛋白質である酵素によって決まります。

物理的にそれらをすべてテストするには 「[特定の酵素のために] 基板のことができる、および」と余りに時間がかかりますたくさんの分子があります Raushel は言いました。 「そう私達は酵素の機能を定める新しい方法のための必要性が」。あったことを決定しました

チームは酵素の三次元 X 線の構造から開始し、次に困惑の部分のような酵素の実行中のサイトに異なったより小さい分子に合うことを試みるのにコンピュータを使用しました。

「各酵素特定のサイズおよび形があります」、に Raushel は言いました、 「および小さい分子を取るのにコンピュータを使用でき、どれだけうまく合ったかそれら酵素の実行中のサイトに一つずつ合われておよびそれらを記録するため。 それはロックに酵素および基板が両方 conformationally 適用範囲が広い」。のでキーの一致のような多かれ少なかれ、もっとたくさん困難ですが

どれだけうまく酵素に合うかコンピュータは分子を記録した後、順序をランク付けし、研究者はそれから物理的にテストするべきかどの分子を決定するのに順位をつけられたリストを使用できます。

「私達が確認する限りでは、これは最初に誰でも使用したありますことが酵素の機能を予測するのに分子ドッキングをです」と Raushel は言いました。 「それは実験および X 線の結晶学両方によって確認され」。

酵素の機能を定めることを試みる他の方法研究者の使用か基板の特定性は物理的にテストのたくさんの可能な分子を含んでいて、近くの遺伝子からの情報を集め、酵素の構造を知られていた機能と他の酵素のそれと比較します。 「私はついに、私達がこれらの方法すべてを一緒に使用しなければならないことと」 Raushel を言いました考えます。 「1 つの単一方法どうしても足りません」。は

Raushel および彼のチームは他の酵素の機能を見つけるのに分子ドッキング方法を使用し続けることを計画します。

ギャップをうめるために 「私達は未知関数がある、私達は」と働いています蛋白質の他の X 線の構造を見て、 Raushel は言いました。 「私達は試みています大将がこの方法どのようにあることを行っているまたは見ることをこのような場合ちょうど幸運」。

Raushel およびテキサス A&M の博士課程終了後の仲間リカルド Marti-Arbona はニューヨークの薬のアルベルト・アインシュタインの大学からの、サンフランシスコおよびスティーブン Almo カリフォルニア大学でブライアン Shoichet と共に働きます。

Raushel は次の 5 年にわたって、新しい薬剤のための潜在的なターゲットを見つけるのにチームが調査結果を使用し始めることができることを望みます。

「ある特定の酵素の基板の特定性を理解することはと」、 Raushel 言いました研究者が病原性のある有機体の 1 つの反作用および人間システムのわずかに異なる反作用に触媒作用を及ぼす酵素を区別することを可能にすることができます。 「これは人間の酵素に影響を与えていない間」。とりわけ病原性のある有機体を目標とする科学者が設計することを可能にします [薬剤]

http://www.tamu.edu/