자물쇠로 키를 적합하 간단한 업무 같이 보일지도 모르지만, 택사스 A&M 대학에 연구원은 효소의 기능을 자물쇠로 열기 위하여 키의 수천 시험 관련시키는 방법을 사용하고 있습니다, 그들의 사실 인정은 약 디자인을 위한 새로운 표적을 위한 문을 열고다.
Frank Raushel 택사스 A&M 연구원은 기질이라고 칭한 어느 분자가 활동으로, 효소를 시작하는지 예상하기 위하여 "분자 단미"에게 불린 기술을 변경한 과학자의 팀의 일부분이어, 혼자 그것의 구조물에 근거를 둔 효소의 기능을 암호문을 해독하는 그(것)들을 가능하게 하.
팀의 종이는 전표 성격에서 간행되었습니다.
대부분의 생물학 프로세스는 화학 반응을 가속화하는 단백질인 효소에 달려있습니다, 그러나 많은 효소의 기능은 신비에 남아 있습니다.
"[특정 효소를 위해] 기질일 수 있던 분자의 수천이 있습니다, 물리적으로 그(것)들을 전부 시험하기 에는 너무 오래 걸리고," Raushel는 말했습니다. "이렇게 우리는 효소의 기능을 결정하는 새로운 방법을 위한 필요가." 있었다는 것을 결정했습니다
팀은 효소의 3차원 엑스레이 구조물에서 시작하고 수수께끼에 있는 피스 같이 효소의 액티브한 사이트에 다른 더 작은 분자를 맞는 것을 시도하도록 그 후에 컴퓨터를 사용했습니다.
"각 효소 특정 규모 및 모양이 있습니다,"에는 Raushel는 말했습니다, "및 작은 분자를 취하기 위하여 컴퓨터를 사용할 수 있고 얼마나 잘 적합했던지 그(것)들이라고 효소의 액티브한 사이트에 하나씩 차례로 맞아 및 그(것)들을 위에 득점하기 위하여. 효소 및 기질이 둘 다 conformationally 유연하기." 때문에 자물쇠로 키를 적합하 같이 다소, 그러나 아주 많게 어렵습니다
효소를 얼마나 잘 적합한지 컴퓨터는 분자를 위에 득점한 후에, 그들의 명령을 평가하고, 연구원은 그 때 우선순위를 매긴 물리적으로 시험할지 어느 분자를 결정하기 위하여 명부를 이용할 수 있습니다.
"우리가 알고 있다 면, 이것은 첫번째로 누군가 이용하습니다 것이 분자 효소의 기능을 예상하기 위하여 단미를 입니다," Raushel는 말했습니다. "그것은 실험과 엑스레이 결정학 둘 다에 의해 검증되고."
효소의 기능을 결정하는 것을 시도하는 그밖 방법 연구원 사용 또는 기질 특이성은 가능한 분자의 물리적으로 시험 수천을 포함해, 가까운 유전자에서 정보를 수집하고, 그리고 효소의 구조물을 알려진 기능과 그밖 효소의 그것에 비교하. "나는 결국, 우리가 이 방법 전부를 함께 사용해야 위하여 할," Raushel를 말했습니다 생각합니다. "1개의 단 하나 방법 다만 충분하지 않을 것입니다."는
Raushel와 그의 팀은 그들의 분자 단미 그밖 효소의 기능을 찾아내기 위하여 방법을 이용하는 계속되 계획합니다.
"우리는 미지 함수가 있는 단백질에는의 그밖 엑스레이 구조물을 보고 있습니다, 그리고 우리는 간격을 메우기 위하여 일하고 있습니다," Raushel는 말했습니다. "우리는 또는 장군이 이 방법 어떻게 이기 위하여 려고 하고 있는지 보는 것을 우리가 이런 특정한 경우에 다만 운이 좋았던 경우에." 시도하고 있습니다
Raushel와 택사스 A&M 박사학위 취득 후 동료 Ricardo Marti-Arbona는 뉴욕에 있는 약의 알베르트 아인슈타인 대학에서, 샌프란시스코 및 Steven Almo 가주 대학에 Brian Shoichet 함께 작동합니다.
Raushel는 다음 5 년 내내, 새로운 약을 위한 잠재적 표적을 찾아내기 위하여 팀이 그것의 사실 인정을 이용하도록 시작할 수 있다는 것을 희망합니다.
"특정 효소의 기질 특이성을 이해하는 것은," Raushel 말했습니다 연구원이 병원성 유기체에 있는 1개의 반응 및 인간 시스템에 있는 약간 다른 반응을 촉매 작용을 미치는 효소를 분화하는 것을 허용할 수 있었습니다. "이것은 인간적인 효소에 영향을 미치지 않으며는 동안." 특히 병원성 유기체를 표적으로 할 과학자가 디자인하는 것을 허용할 것입니다 [약]
http://www.tamu.edu/