Caber uma chave em um fechamento pode parecer como uma tarefa simples, mas os pesquisadores na Universidade de Texas A&M estão usando um método que envolva testar milhares de chaves para destravar as funções das enzimas, e seus resultados poderiam abrir a porta para alvos novos para projectos da droga.
O pesquisador Frank Raushel de Texas A&M é parte de uma equipe dos cientistas que alteraram uma técnica chamada “o embarcadouro molecular” para prever que molécula, chamada uma carcaça, provoca uma enzima na acção, permitindo os de decifrar a função de uma enzima baseada em sua estrutura apenas.
O papel da equipe foi publicado na Natureza do jornal.
A Maioria de processos biológicos dependem das enzimas, que são as proteínas que aceleram reacções químicas, mas a função de muitas enzimas permanece um mistério.
“Há uns milhares de moléculas que poderiam ser carcaças [para uma enzima específica], e tomaria demasiado por muito tempo para testá-las fisicamente todas,” Raushel disse. “Assim nós decidimos que havia uma necessidade para que um método novo determine a função das enzimas.”
A equipe começou com a estrutura tridimensional do Raio X de uma enzima e usou então um computador para tentar caber moléculas menores diferentes no local activo da enzima como partes em um enigma.
“Cada enzima tem um tamanho e uma forma específicos,” Raushel disse, “e você pode usar um computador para tomar moléculas pequenas e cabido lhes no local activo de uma enzima um por um e para marcar-las em como bom cabem. É mais ou menos como caber uma chave em um fechamento, mas muito mais difícil desde que a enzima e a carcaça são conformationally flexíveis.”
Depois Que o computador marca as moléculas em como bom cabem a enzima, classifica seu pedido, e os pesquisadores podem então usar a lista prioritária para decidir que moléculas a testar fisicamente.
“Tanto quanto nós sabemos, este é qualquer um tem usado a primeira vez o embarcadouro molecular para prever a função de uma enzima,” Raushel disse. “E foi verificada pela experiência e pelo cristalografia do Raio X.”
O Outro uso dos pesquisadores dos métodos tentar determinar a função de uma enzima ou a especificidade da carcaça incluem milhares fisicamente de teste de moléculas possíveis, recolhendo a informação dos genes próximos, e comparando a estrutura da enzima àquela de outras enzimas com as funções conhecidas. “Eu penso aquele na extremidade, nós teremos que usar junto todos estes métodos,” Raushel disse. “Um único método apenas não bastará.”