Приспособление ключа в замок может показаться как простая задача, но исследователя на Университете Техас A&M используют метод который включает испытать тысячи ключей для того чтобы открыть функции энзимов, и их заключения смогли раскрыть дверь для новых целей для конструкций снадобья.
Исследователь Франк Raushel Техас A&M часть команды научных работников которые доработали вызванный метод «молекулярной стыковкой» для того чтобы предсказать которая вызванная молекула, субстратом, вызывает энзим в действие, позволяющ они расшифровать функцию энзима основанную на своей структуре самостоятельно.
Бумага команды была опубликована в Природе журнала.
Большинств энзимы быть в зависимости от биологических процессов, которые протеины которые быстро проходят вверх по химическим реакциям, но функция много энзимов остают тайной.
«Тысячи молекул которые смогли быть субстратами [для специфического энзима], и он принял бы слишком длиной физически для того чтобы испытать их все,» Raushel сказало. «Так мы решили что была потребность для нового метода определить функцию энзимов.»
Команда начала с трехмерной структурой Рентгеновского Снимка энзима и после этого использовала компьютер для того чтобы попробовать поместить различные более малые молекулы в активное место энзима как части в головоломке.
«Каждый энзим имеет специфические размер и форму,» Raushel сказало, «и вы можете использовать компьютер для того чтобы принять малые молекулы и приспособлено им в активное место энзима по-одному и вести счет их на как хороше они приспосабливают. Больше или как приспособление ключа в замок, но намного больше трудное в виду того что и энзим и субстрат conformationally гибки.»
После компьютера ведет счет молекулы на как хороше они приспосабливают энзим, оно выстраивает в ряд их заказ, и исследователя могут после этого использовать оказанный предпочтение список для того чтобы решить которые молекулы физически, котор нужно испытать.
«Насколько нам известно, это the first time кто-нибудь использовало молекулярную стыковку для того чтобы предсказать функцию энзима,» Raushel сказало. «И было подтвержено как экспериментом, так и кристаллографией Рентгеновского Снимка.»